Protein–RNA interactions for Protein: P0DJD1

RGPD2, RANBP2-like and GRIP domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD2P0DJD1 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RGPD2P0DJD1 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RGPD2P0DJD1 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RGPD2P0DJD1 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
RGPD2P0DJD1 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RGPD2P0DJD1 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
RGPD2P0DJD1 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RGPD2P0DJD1 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RGPD2P0DJD1 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
RGPD2P0DJD1 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
RGPD2P0DJD1 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RGPD2P0DJD1 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RGPD2P0DJD1 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RGPD2P0DJD1 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RGPD2P0DJD1 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RGPD2P0DJD1 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RGPD2P0DJD1 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RGPD2P0DJD1 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RGPD2P0DJD1 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RGPD2P0DJD1 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RGPD2P0DJD1 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RGPD2P0DJD1 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RGPD2P0DJD1 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
RGPD2P0DJD1 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RGPD2P0DJD1 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RGPD2P0DJD1 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RGPD2P0DJD1 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
RGPD2P0DJD1 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RGPD2P0DJD1 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RGPD2P0DJD1 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RGPD2P0DJD1 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RGPD2P0DJD1 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RGPD2P0DJD1 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RGPD2P0DJD1 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
RGPD2P0DJD1 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RGPD2P0DJD1 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RGPD2P0DJD1 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RGPD2P0DJD1 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RGPD2P0DJD1 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RGPD2P0DJD1 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RGPD2P0DJD1 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RGPD2P0DJD1 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RGPD2P0DJD1 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RGPD2P0DJD1 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RGPD2P0DJD1 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RGPD2P0DJD1 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RGPD2P0DJD1 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RGPD2P0DJD1 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RGPD2P0DJD1 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RGPD2P0DJD1 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RGPD2P0DJD1 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RGPD2P0DJD1 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RGPD2P0DJD1 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
RGPD2P0DJD1 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RGPD2P0DJD1 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RGPD2P0DJD1 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RGPD2P0DJD1 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RGPD2P0DJD1 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RGPD2P0DJD1 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RGPD2P0DJD1 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RGPD2P0DJD1 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
RGPD2P0DJD1 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RGPD2P0DJD1 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RGPD2P0DJD1 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RGPD2P0DJD1 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
RGPD2P0DJD1 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RGPD2P0DJD1 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RGPD2P0DJD1 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RGPD2P0DJD1 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RGPD2P0DJD1 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RGPD2P0DJD1 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RGPD2P0DJD1 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RGPD2P0DJD1 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RGPD2P0DJD1 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RGPD2P0DJD1 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RGPD2P0DJD1 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RGPD2P0DJD1 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RGPD2P0DJD1 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RGPD2P0DJD1 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RGPD2P0DJD1 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RGPD2P0DJD1 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RGPD2P0DJD1 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RGPD2P0DJD1 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RGPD2P0DJD1 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RGPD2P0DJD1 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RGPD2P0DJD1 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RGPD2P0DJD1 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RGPD2P0DJD1 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
RGPD2P0DJD1 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RGPD2P0DJD1 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RGPD2P0DJD1 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RGPD2P0DJD1 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RGPD2P0DJD1 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RGPD2P0DJD1 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RGPD2P0DJD1 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RGPD2P0DJD1 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RGPD2P0DJD1 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RGPD2P0DJD1 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RGPD2P0DJD1 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RGPD2P0DJD1 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms