Protein–RNA interactions for Protein: P0CW27

CCDC166, Coiled-coil domain-containing protein 166, humanhuman

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC166P0CW27 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC166P0CW27 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC166P0CW27 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC166P0CW27 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC166P0CW27 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC166P0CW27 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC166P0CW27 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC166P0CW27 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC166P0CW27 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC166P0CW27 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC166P0CW27 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC166P0CW27 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC166P0CW27 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC166P0CW27 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC166P0CW27 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC166P0CW27 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC166P0CW27 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC166P0CW27 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC166P0CW27 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC166P0CW27 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC166P0CW27 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC166P0CW27 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC166P0CW27 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC166P0CW27 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC166P0CW27 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC166P0CW27 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC166P0CW27 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC166P0CW27 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC166P0CW27 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC166P0CW27 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC166P0CW27 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC166P0CW27 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC166P0CW27 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC166P0CW27 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC166P0CW27 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC166P0CW27 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC166P0CW27 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC166P0CW27 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC166P0CW27 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC166P0CW27 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC166P0CW27 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC166P0CW27 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC166P0CW27 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC166P0CW27 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC166P0CW27 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC166P0CW27 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC166P0CW27 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC166P0CW27 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC166P0CW27 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC166P0CW27 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC166P0CW27 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC166P0CW27 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC166P0CW27 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC166P0CW27 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC166P0CW27 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC166P0CW27 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC166P0CW27 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC166P0CW27 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC166P0CW27 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC166P0CW27 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC166P0CW27 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC166P0CW27 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC166P0CW27 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC166P0CW27 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC166P0CW27 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC166P0CW27 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC166P0CW27 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC166P0CW27 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC166P0CW27 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC166P0CW27 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC166P0CW27 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC166P0CW27 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC166P0CW27 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC166P0CW27 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC166P0CW27 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC166P0CW27 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC166P0CW27 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC166P0CW27 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC166P0CW27 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC166P0CW27 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC166P0CW27 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC166P0CW27 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC166P0CW27 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC166P0CW27 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC166P0CW27 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC166P0CW27 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC166P0CW27 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC166P0CW27 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC166P0CW27 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC166P0CW27 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC166P0CW27 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC166P0CW27 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC166P0CW27 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC166P0CW27 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC166P0CW27 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC166P0CW27 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC166P0CW27 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC166P0CW27 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC166P0CW27 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC166P0CW27 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms