Protein–RNA interactions for Protein: P07199

CENPB, Major centromere autoantigen B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPBP07199 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CENPBP07199 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CENPBP07199 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CENPBP07199 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CENPBP07199 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CENPBP07199 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CENPBP07199 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CENPBP07199 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
CENPBP07199 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CENPBP07199 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CENPBP07199 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CENPBP07199 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CENPBP07199 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CENPBP07199 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CENPBP07199 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CENPBP07199 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CENPBP07199 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CENPBP07199 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CENPBP07199 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CENPBP07199 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CENPBP07199 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CENPBP07199 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CENPBP07199 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CENPBP07199 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CENPBP07199 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CENPBP07199 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CENPBP07199 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CENPBP07199 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
CENPBP07199 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CENPBP07199 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CENPBP07199 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
CENPBP07199 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CENPBP07199 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CENPBP07199 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CENPBP07199 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CENPBP07199 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CENPBP07199 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CENPBP07199 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CENPBP07199 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CENPBP07199 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CENPBP07199 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CENPBP07199 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CENPBP07199 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CENPBP07199 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CENPBP07199 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CENPBP07199 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CENPBP07199 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CENPBP07199 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CENPBP07199 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CENPBP07199 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CENPBP07199 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CENPBP07199 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CENPBP07199 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CENPBP07199 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CENPBP07199 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CENPBP07199 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CENPBP07199 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CENPBP07199 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CENPBP07199 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CENPBP07199 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CENPBP07199 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CENPBP07199 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CENPBP07199 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CENPBP07199 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CENPBP07199 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CENPBP07199 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CENPBP07199 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CENPBP07199 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
CENPBP07199 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CENPBP07199 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CENPBP07199 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CENPBP07199 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CENPBP07199 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CENPBP07199 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CENPBP07199 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CENPBP07199 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CENPBP07199 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CENPBP07199 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CENPBP07199 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CENPBP07199 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CENPBP07199 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CENPBP07199 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CENPBP07199 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CENPBP07199 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CENPBP07199 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CENPBP07199 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CENPBP07199 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CENPBP07199 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CENPBP07199 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CENPBP07199 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CENPBP07199 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CENPBP07199 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CENPBP07199 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CENPBP07199 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CENPBP07199 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CENPBP07199 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CENPBP07199 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CENPBP07199 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CENPBP07199 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CENPBP07199 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms