Protein–RNA interactions for Protein: P04280

PRB1, Basic salivary proline-rich protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 392 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRB1P04280 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PRB1P04280 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PRB1P04280 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PRB1P04280 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PRB1P04280 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PRB1P04280 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PRB1P04280 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRB1P04280 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRB1P04280 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRB1P04280 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRB1P04280 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRB1P04280 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRB1P04280 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRB1P04280 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRB1P04280 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRB1P04280 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRB1P04280 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRB1P04280 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRB1P04280 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRB1P04280 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRB1P04280 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRB1P04280 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRB1P04280 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRB1P04280 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRB1P04280 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRB1P04280 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRB1P04280 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PRB1P04280 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRB1P04280 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRB1P04280 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRB1P04280 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PRB1P04280 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRB1P04280 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRB1P04280 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRB1P04280 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRB1P04280 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRB1P04280 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRB1P04280 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PRB1P04280 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRB1P04280 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRB1P04280 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PRB1P04280 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PRB1P04280 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PRB1P04280 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PRB1P04280 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PRB1P04280 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PRB1P04280 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PRB1P04280 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PRB1P04280 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PRB1P04280 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PRB1P04280 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PRB1P04280 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PRB1P04280 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PRB1P04280 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PRB1P04280 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PRB1P04280 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PRB1P04280 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PRB1P04280 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PRB1P04280 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PRB1P04280 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PRB1P04280 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
PRB1P04280 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PRB1P04280 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PRB1P04280 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PRB1P04280 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PRB1P04280 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PRB1P04280 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PRB1P04280 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PRB1P04280 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PRB1P04280 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PRB1P04280 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PRB1P04280 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PRB1P04280 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
PRB1P04280 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PRB1P04280 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRB1P04280 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRB1P04280 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRB1P04280 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRB1P04280 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRB1P04280 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRB1P04280 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRB1P04280 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRB1P04280 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRB1P04280 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRB1P04280 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PRB1P04280 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRB1P04280 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PRB1P04280 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRB1P04280 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRB1P04280 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PRB1P04280 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRB1P04280 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRB1P04280 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PRB1P04280 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRB1P04280 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRB1P04280 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRB1P04280 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRB1P04280 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRB1P04280 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRB1P04280 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms