Protein–RNA interactions for Protein: P01766

IGHV3-13, Immunoglobulin heavy variable 3-13, humanhuman

Predictions only

Length 116 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGHV3-13P01766 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IGHV3-13P01766 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IGHV3-13P01766 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IGHV3-13P01766 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IGHV3-13P01766 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IGHV3-13P01766 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IGHV3-13P01766 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
IGHV3-13P01766 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IGHV3-13P01766 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IGHV3-13P01766 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
IGHV3-13P01766 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IGHV3-13P01766 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IGHV3-13P01766 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IGHV3-13P01766 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
IGHV3-13P01766 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IGHV3-13P01766 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IGHV3-13P01766 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IGHV3-13P01766 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
IGHV3-13P01766 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IGHV3-13P01766 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IGHV3-13P01766 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IGHV3-13P01766 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IGHV3-13P01766 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IGHV3-13P01766 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
IGHV3-13P01766 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
IGHV3-13P01766 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
IGHV3-13P01766 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IGHV3-13P01766 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
IGHV3-13P01766 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
IGHV3-13P01766 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IGHV3-13P01766 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
IGHV3-13P01766 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
IGHV3-13P01766 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
IGHV3-13P01766 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IGHV3-13P01766 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IGHV3-13P01766 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
IGHV3-13P01766 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IGHV3-13P01766 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IGHV3-13P01766 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
IGHV3-13P01766 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IGHV3-13P01766 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IGHV3-13P01766 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IGHV3-13P01766 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IGHV3-13P01766 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IGHV3-13P01766 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
IGHV3-13P01766 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
IGHV3-13P01766 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
IGHV3-13P01766 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
IGHV3-13P01766 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
IGHV3-13P01766 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
IGHV3-13P01766 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
IGHV3-13P01766 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
IGHV3-13P01766 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
IGHV3-13P01766 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
IGHV3-13P01766 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
IGHV3-13P01766 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
IGHV3-13P01766 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
IGHV3-13P01766 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
IGHV3-13P01766 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
IGHV3-13P01766 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
IGHV3-13P01766 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
IGHV3-13P01766 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
IGHV3-13P01766 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
IGHV3-13P01766 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
IGHV3-13P01766 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
IGHV3-13P01766 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
IGHV3-13P01766 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
IGHV3-13P01766 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
IGHV3-13P01766 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
IGHV3-13P01766 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
IGHV3-13P01766 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
IGHV3-13P01766 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.06
IGHV3-13P01766 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
IGHV3-13P01766 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
IGHV3-13P01766 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
IGHV3-13P01766 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
IGHV3-13P01766 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
IGHV3-13P01766 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
IGHV3-13P01766 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
IGHV3-13P01766 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
IGHV3-13P01766 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
IGHV3-13P01766 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
IGHV3-13P01766 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
IGHV3-13P01766 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
IGHV3-13P01766 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
IGHV3-13P01766 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
IGHV3-13P01766 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
IGHV3-13P01766 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
IGHV3-13P01766 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
IGHV3-13P01766 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
IGHV3-13P01766 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
IGHV3-13P01766 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
IGHV3-13P01766 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
IGHV3-13P01766 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
IGHV3-13P01766 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
IGHV3-13P01766 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
IGHV3-13P01766 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
IGHV3-13P01766 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
IGHV3-13P01766 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
IGHV3-13P01766 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms