Protein–RNA interactions for Protein: O75364

PITX3, Pituitary homeobox 3, humanhuman

Predictions only

Length 302 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX3O75364 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PITX3O75364 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PITX3O75364 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PITX3O75364 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
PITX3O75364 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PITX3O75364 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PITX3O75364 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PITX3O75364 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PITX3O75364 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PITX3O75364 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PITX3O75364 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PITX3O75364 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PITX3O75364 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PITX3O75364 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PITX3O75364 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PITX3O75364 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PITX3O75364 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PITX3O75364 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PITX3O75364 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PITX3O75364 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
PITX3O75364 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
PITX3O75364 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
PITX3O75364 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
PITX3O75364 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PITX3O75364 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PITX3O75364 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PITX3O75364 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PITX3O75364 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PITX3O75364 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PITX3O75364 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PITX3O75364 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
PITX3O75364 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PITX3O75364 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PITX3O75364 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PITX3O75364 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PITX3O75364 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PITX3O75364 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PITX3O75364 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PITX3O75364 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
PITX3O75364 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PITX3O75364 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PITX3O75364 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PITX3O75364 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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PITX3O75364 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PITX3O75364 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
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PITX3O75364 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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PITX3O75364 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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PITX3O75364 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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PITX3O75364 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PITX3O75364 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
PITX3O75364 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PITX3O75364 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PITX3O75364 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PITX3O75364 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PITX3O75364 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PITX3O75364 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
PITX3O75364 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PITX3O75364 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PITX3O75364 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
PITX3O75364 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PITX3O75364 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PITX3O75364 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PITX3O75364 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PITX3O75364 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PITX3O75364 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PITX3O75364 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PITX3O75364 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PITX3O75364 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PITX3O75364 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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