Protein–RNA interactions for Protein: O75323

NIPSNAP2, Protein NipSnap homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP2O75323 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
NIPSNAP2O75323 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
NIPSNAP2O75323 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
NIPSNAP2O75323 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
NIPSNAP2O75323 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
NIPSNAP2O75323 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
NIPSNAP2O75323 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NIPSNAP2O75323 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NIPSNAP2O75323 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NIPSNAP2O75323 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NIPSNAP2O75323 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NIPSNAP2O75323 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NIPSNAP2O75323 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NIPSNAP2O75323 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NIPSNAP2O75323 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
NIPSNAP2O75323 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NIPSNAP2O75323 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NIPSNAP2O75323 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NIPSNAP2O75323 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
NIPSNAP2O75323 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
NIPSNAP2O75323 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NIPSNAP2O75323 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NIPSNAP2O75323 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NIPSNAP2O75323 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NIPSNAP2O75323 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NIPSNAP2O75323 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NIPSNAP2O75323 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NIPSNAP2O75323 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NIPSNAP2O75323 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NIPSNAP2O75323 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NIPSNAP2O75323 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NIPSNAP2O75323 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NIPSNAP2O75323 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NIPSNAP2O75323 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NIPSNAP2O75323 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NIPSNAP2O75323 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
NIPSNAP2O75323 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NIPSNAP2O75323 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NIPSNAP2O75323 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NIPSNAP2O75323 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NIPSNAP2O75323 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NIPSNAP2O75323 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NIPSNAP2O75323 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NIPSNAP2O75323 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NIPSNAP2O75323 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NIPSNAP2O75323 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NIPSNAP2O75323 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NIPSNAP2O75323 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NIPSNAP2O75323 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NIPSNAP2O75323 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NIPSNAP2O75323 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NIPSNAP2O75323 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NIPSNAP2O75323 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NIPSNAP2O75323 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NIPSNAP2O75323 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
NIPSNAP2O75323 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NIPSNAP2O75323 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NIPSNAP2O75323 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NIPSNAP2O75323 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NIPSNAP2O75323 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NIPSNAP2O75323 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
NIPSNAP2O75323 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NIPSNAP2O75323 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NIPSNAP2O75323 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NIPSNAP2O75323 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NIPSNAP2O75323 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NIPSNAP2O75323 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
NIPSNAP2O75323 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NIPSNAP2O75323 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NIPSNAP2O75323 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NIPSNAP2O75323 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NIPSNAP2O75323 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NIPSNAP2O75323 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NIPSNAP2O75323 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NIPSNAP2O75323 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NIPSNAP2O75323 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NIPSNAP2O75323 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NIPSNAP2O75323 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NIPSNAP2O75323 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NIPSNAP2O75323 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NIPSNAP2O75323 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NIPSNAP2O75323 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NIPSNAP2O75323 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NIPSNAP2O75323 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NIPSNAP2O75323 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NIPSNAP2O75323 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NIPSNAP2O75323 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
NIPSNAP2O75323 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NIPSNAP2O75323 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NIPSNAP2O75323 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NIPSNAP2O75323 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NIPSNAP2O75323 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NIPSNAP2O75323 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NIPSNAP2O75323 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NIPSNAP2O75323 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NIPSNAP2O75323 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NIPSNAP2O75323 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NIPSNAP2O75323 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NIPSNAP2O75323 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NIPSNAP2O75323 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms