Protein–RNA interactions for Protein: O60931

CTNS, Cystinosin, humanhuman

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNSO60931 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CTNSO60931 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CTNSO60931 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CTNSO60931 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CTNSO60931 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CTNSO60931 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CTNSO60931 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CTNSO60931 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CTNSO60931 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CTNSO60931 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
CTNSO60931 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
CTNSO60931 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
CTNSO60931 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
CTNSO60931 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CTNSO60931 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CTNSO60931 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CTNSO60931 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CTNSO60931 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CTNSO60931 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CTNSO60931 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CTNSO60931 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CTNSO60931 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CTNSO60931 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CTNSO60931 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CTNSO60931 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
CTNSO60931 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CTNSO60931 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CTNSO60931 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CTNSO60931 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CTNSO60931 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CTNSO60931 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CTNSO60931 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CTNSO60931 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
CTNSO60931 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CTNSO60931 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CTNSO60931 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CTNSO60931 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CTNSO60931 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CTNSO60931 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CTNSO60931 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
CTNSO60931 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CTNSO60931 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CTNSO60931 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CTNSO60931 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CTNSO60931 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CTNSO60931 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CTNSO60931 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CTNSO60931 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CTNSO60931 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CTNSO60931 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CTNSO60931 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CTNSO60931 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CTNSO60931 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CTNSO60931 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CTNSO60931 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CTNSO60931 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CTNSO60931 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CTNSO60931 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CTNSO60931 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CTNSO60931 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CTNSO60931 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CTNSO60931 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CTNSO60931 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
CTNSO60931 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
CTNSO60931 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CTNSO60931 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CTNSO60931 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CTNSO60931 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CTNSO60931 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CTNSO60931 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CTNSO60931 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CTNSO60931 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CTNSO60931 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CTNSO60931 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CTNSO60931 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CTNSO60931 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CTNSO60931 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CTNSO60931 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CTNSO60931 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
CTNSO60931 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CTNSO60931 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CTNSO60931 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CTNSO60931 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CTNSO60931 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CTNSO60931 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CTNSO60931 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CTNSO60931 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CTNSO60931 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CTNSO60931 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CTNSO60931 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CTNSO60931 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CTNSO60931 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CTNSO60931 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CTNSO60931 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CTNSO60931 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CTNSO60931 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CTNSO60931 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CTNSO60931 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
CTNSO60931 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CTNSO60931 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms