Protein–RNA interactions for Protein: O43679

LDB2, LIM domain-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LDB2O43679 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LDB2O43679 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LDB2O43679 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
LDB2O43679 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LDB2O43679 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LDB2O43679 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LDB2O43679 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LDB2O43679 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LDB2O43679 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LDB2O43679 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LDB2O43679 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LDB2O43679 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LDB2O43679 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LDB2O43679 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LDB2O43679 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LDB2O43679 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LDB2O43679 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
LDB2O43679 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LDB2O43679 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LDB2O43679 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LDB2O43679 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LDB2O43679 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LDB2O43679 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LDB2O43679 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LDB2O43679 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LDB2O43679 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LDB2O43679 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LDB2O43679 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LDB2O43679 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
LDB2O43679 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LDB2O43679 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LDB2O43679 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LDB2O43679 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LDB2O43679 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LDB2O43679 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LDB2O43679 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LDB2O43679 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LDB2O43679 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LDB2O43679 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LDB2O43679 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LDB2O43679 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LDB2O43679 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LDB2O43679 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LDB2O43679 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LDB2O43679 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LDB2O43679 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LDB2O43679 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LDB2O43679 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LDB2O43679 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LDB2O43679 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
LDB2O43679 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LDB2O43679 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LDB2O43679 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LDB2O43679 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LDB2O43679 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LDB2O43679 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LDB2O43679 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LDB2O43679 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LDB2O43679 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
LDB2O43679 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LDB2O43679 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LDB2O43679 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LDB2O43679 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LDB2O43679 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LDB2O43679 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LDB2O43679 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LDB2O43679 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
LDB2O43679 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
LDB2O43679 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
LDB2O43679 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LDB2O43679 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
LDB2O43679 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
LDB2O43679 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
LDB2O43679 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
LDB2O43679 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
LDB2O43679 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
LDB2O43679 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
LDB2O43679 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
LDB2O43679 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
LDB2O43679 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LDB2O43679 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LDB2O43679 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LDB2O43679 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LDB2O43679 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LDB2O43679 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LDB2O43679 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LDB2O43679 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LDB2O43679 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LDB2O43679 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LDB2O43679 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LDB2O43679 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
LDB2O43679 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LDB2O43679 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LDB2O43679 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LDB2O43679 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LDB2O43679 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LDB2O43679 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LDB2O43679 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LDB2O43679 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LDB2O43679 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.2 ms