Protein–RNA interactions for Protein: O43497

CACNA1G, Voltage-dependent T-type calcium channel subunit alpha-1G, humanhuman

Predictions only

Length 2,377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1GO43497 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CACNA1GO43497 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CACNA1GO43497 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CACNA1GO43497 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CACNA1GO43497 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CACNA1GO43497 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CACNA1GO43497 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CACNA1GO43497 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CACNA1GO43497 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CACNA1GO43497 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CACNA1GO43497 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CACNA1GO43497 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CACNA1GO43497 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CACNA1GO43497 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CACNA1GO43497 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CACNA1GO43497 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CACNA1GO43497 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CACNA1GO43497 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CACNA1GO43497 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CACNA1GO43497 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CACNA1GO43497 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CACNA1GO43497 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CACNA1GO43497 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CACNA1GO43497 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CACNA1GO43497 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CACNA1GO43497 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CACNA1GO43497 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CACNA1GO43497 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CACNA1GO43497 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CACNA1GO43497 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CACNA1GO43497 TBC1D16-205ENST00000572862 1141 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CACNA1GO43497 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CACNA1GO43497 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CACNA1GO43497 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CACNA1GO43497 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CACNA1GO43497 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CACNA1GO43497 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CACNA1GO43497 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CACNA1GO43497 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CACNA1GO43497 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CACNA1GO43497 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CACNA1GO43497 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CACNA1GO43497 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CACNA1GO43497 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CACNA1GO43497 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CACNA1GO43497 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CACNA1GO43497 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CACNA1GO43497 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CACNA1GO43497 SFTA2-203ENST00000634371 815 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CACNA1GO43497 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CACNA1GO43497 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CACNA1GO43497 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CACNA1GO43497 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CACNA1GO43497 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CACNA1GO43497 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CACNA1GO43497 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CACNA1GO43497 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CACNA1GO43497 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CACNA1GO43497 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CACNA1GO43497 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CACNA1GO43497 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CACNA1GO43497 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CACNA1GO43497 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CACNA1GO43497 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CACNA1GO43497 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CACNA1GO43497 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CACNA1GO43497 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CACNA1GO43497 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CACNA1GO43497 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CACNA1GO43497 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CACNA1GO43497 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CACNA1GO43497 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CACNA1GO43497 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CACNA1GO43497 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CACNA1GO43497 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CACNA1GO43497 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CACNA1GO43497 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CACNA1GO43497 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CACNA1GO43497 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CACNA1GO43497 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CACNA1GO43497 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CACNA1GO43497 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CACNA1GO43497 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CACNA1GO43497 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CACNA1GO43497 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CACNA1GO43497 POLD4-201ENST00000312419 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
CACNA1GO43497 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.26
CACNA1GO43497 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
CACNA1GO43497 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
CACNA1GO43497 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
CACNA1GO43497 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
CACNA1GO43497 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC16.71■□□□□ 0.26
CACNA1GO43497 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.26
CACNA1GO43497 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC16.71■□□□□ 0.26
CACNA1GO43497 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
CACNA1GO43497 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.26
CACNA1GO43497 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC16.71■□□□□ 0.26
CACNA1GO43497 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
CACNA1GO43497 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
CACNA1GO43497 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms