Protein–RNA interactions for Protein: O43272

PRODH, Proline dehydrogenase 1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 600 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRODHO43272 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRODHO43272 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRODHO43272 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRODHO43272 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRODHO43272 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRODHO43272 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRODHO43272 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRODHO43272 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRODHO43272 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRODHO43272 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRODHO43272 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRODHO43272 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRODHO43272 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRODHO43272 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRODHO43272 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRODHO43272 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRODHO43272 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRODHO43272 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRODHO43272 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRODHO43272 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRODHO43272 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRODHO43272 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRODHO43272 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRODHO43272 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRODHO43272 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRODHO43272 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRODHO43272 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRODHO43272 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PRODHO43272 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRODHO43272 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRODHO43272 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRODHO43272 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRODHO43272 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRODHO43272 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PRODHO43272 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PRODHO43272 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRODHO43272 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRODHO43272 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRODHO43272 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PRODHO43272 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRODHO43272 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRODHO43272 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PRODHO43272 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRODHO43272 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PRODHO43272 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRODHO43272 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRODHO43272 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRODHO43272 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRODHO43272 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRODHO43272 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRODHO43272 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRODHO43272 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRODHO43272 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRODHO43272 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRODHO43272 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRODHO43272 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRODHO43272 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRODHO43272 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRODHO43272 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRODHO43272 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRODHO43272 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRODHO43272 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRODHO43272 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRODHO43272 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRODHO43272 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
PRODHO43272 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRODHO43272 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRODHO43272 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRODHO43272 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRODHO43272 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRODHO43272 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRODHO43272 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRODHO43272 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRODHO43272 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRODHO43272 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRODHO43272 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRODHO43272 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
PRODHO43272 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRODHO43272 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRODHO43272 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
PRODHO43272 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRODHO43272 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRODHO43272 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRODHO43272 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRODHO43272 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRODHO43272 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRODHO43272 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRODHO43272 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRODHO43272 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRODHO43272 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
PRODHO43272 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRODHO43272 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRODHO43272 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRODHO43272 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRODHO43272 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRODHO43272 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRODHO43272 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRODHO43272 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
PRODHO43272 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRODHO43272 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms