Protein–RNA interactions for Protein: O43186

CRX, Cone-rod homeobox protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 299 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRXO43186 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
CRXO43186 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
CRXO43186 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
CRXO43186 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
CRXO43186 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC13.83□□□□□ -0.2
CRXO43186 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
CRXO43186 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
CRXO43186 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
CRXO43186 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
CRXO43186 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
CRXO43186 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC13.83□□□□□ -0.2
CRXO43186 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
CRXO43186 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
CRXO43186 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
CRXO43186 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
CRXO43186 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
CRXO43186 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
CRXO43186 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
CRXO43186 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
CRXO43186 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
CRXO43186 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
CRXO43186 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
CRXO43186 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
CRXO43186 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
CRXO43186 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
CRXO43186 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
CRXO43186 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
CRXO43186 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
CRXO43186 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
CRXO43186 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
CRXO43186 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
CRXO43186 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
CRXO43186 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
CRXO43186 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
CRXO43186 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
CRXO43186 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
CRXO43186 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
CRXO43186 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
CRXO43186 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
CRXO43186 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
CRXO43186 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
CRXO43186 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
CRXO43186 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
CRXO43186 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
CRXO43186 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
CRXO43186 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
CRXO43186 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
CRXO43186 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
CRXO43186 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
CRXO43186 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
CRXO43186 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC13.82□□□□□ -0.2
CRXO43186 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
CRXO43186 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC13.82□□□□□ -0.2
CRXO43186 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC13.82□□□□□ -0.2
CRXO43186 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
CRXO43186 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
CRXO43186 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
CRXO43186 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
CRXO43186 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
CRXO43186 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
CRXO43186 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
CRXO43186 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
CRXO43186 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
CRXO43186 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
CRXO43186 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
CRXO43186 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
CRXO43186 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
CRXO43186 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
CRXO43186 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
CRXO43186 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
CRXO43186 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
CRXO43186 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
CRXO43186 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
CRXO43186 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
CRXO43186 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
CRXO43186 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
CRXO43186 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
CRXO43186 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
CRXO43186 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
CRXO43186 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
CRXO43186 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
CRXO43186 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
CRXO43186 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
CRXO43186 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
CRXO43186 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
CRXO43186 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
CRXO43186 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
CRXO43186 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
CRXO43186 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
CRXO43186 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
CRXO43186 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
CRXO43186 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
CRXO43186 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
CRXO43186 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
CRXO43186 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC13.81□□□□□ -0.2
CRXO43186 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC13.81□□□□□ -0.2
CRXO43186 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC13.81□□□□□ -0.2
CRXO43186 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
CRXO43186 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
CRXO43186 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
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