Protein–RNA interactions for Protein: O15516

CLOCK, Circadian locomoter output cycles protein kaput, humanhuman

Predictions only

Length 846 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLOCKO15516 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLOCKO15516 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLOCKO15516 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLOCKO15516 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLOCKO15516 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLOCKO15516 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CLOCKO15516 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLOCKO15516 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLOCKO15516 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLOCKO15516 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLOCKO15516 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLOCKO15516 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLOCKO15516 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLOCKO15516 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLOCKO15516 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLOCKO15516 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLOCKO15516 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLOCKO15516 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLOCKO15516 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLOCKO15516 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLOCKO15516 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CLOCKO15516 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLOCKO15516 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLOCKO15516 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLOCKO15516 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLOCKO15516 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLOCKO15516 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLOCKO15516 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLOCKO15516 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLOCKO15516 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLOCKO15516 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLOCKO15516 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLOCKO15516 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLOCKO15516 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLOCKO15516 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLOCKO15516 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLOCKO15516 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CLOCKO15516 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CLOCKO15516 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLOCKO15516 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLOCKO15516 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLOCKO15516 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLOCKO15516 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLOCKO15516 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLOCKO15516 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLOCKO15516 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLOCKO15516 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLOCKO15516 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLOCKO15516 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLOCKO15516 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLOCKO15516 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLOCKO15516 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLOCKO15516 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLOCKO15516 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLOCKO15516 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLOCKO15516 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLOCKO15516 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLOCKO15516 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLOCKO15516 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLOCKO15516 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLOCKO15516 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLOCKO15516 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLOCKO15516 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLOCKO15516 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLOCKO15516 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLOCKO15516 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLOCKO15516 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLOCKO15516 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLOCKO15516 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLOCKO15516 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLOCKO15516 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLOCKO15516 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLOCKO15516 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CLOCKO15516 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CLOCKO15516 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CLOCKO15516 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLOCKO15516 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLOCKO15516 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CLOCKO15516 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLOCKO15516 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLOCKO15516 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLOCKO15516 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CLOCKO15516 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLOCKO15516 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLOCKO15516 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLOCKO15516 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLOCKO15516 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLOCKO15516 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLOCKO15516 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLOCKO15516 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLOCKO15516 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLOCKO15516 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLOCKO15516 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLOCKO15516 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLOCKO15516 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLOCKO15516 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLOCKO15516 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLOCKO15516 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLOCKO15516 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLOCKO15516 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.1 ms