Protein–RNA interactions for Protein: O00411

POLRMT, DNA-directed RNA polymerase, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLRMTO00411 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
POLRMTO00411 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
POLRMTO00411 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
POLRMTO00411 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
POLRMTO00411 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
POLRMTO00411 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
POLRMTO00411 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
POLRMTO00411 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
POLRMTO00411 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
POLRMTO00411 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
POLRMTO00411 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
POLRMTO00411 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
POLRMTO00411 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
POLRMTO00411 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
POLRMTO00411 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
POLRMTO00411 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
POLRMTO00411 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
POLRMTO00411 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
POLRMTO00411 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
POLRMTO00411 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
POLRMTO00411 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
POLRMTO00411 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
POLRMTO00411 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
POLRMTO00411 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
POLRMTO00411 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
POLRMTO00411 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
POLRMTO00411 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
POLRMTO00411 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
POLRMTO00411 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
POLRMTO00411 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
POLRMTO00411 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
POLRMTO00411 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
POLRMTO00411 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
POLRMTO00411 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
POLRMTO00411 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
POLRMTO00411 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
POLRMTO00411 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
POLRMTO00411 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
POLRMTO00411 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
POLRMTO00411 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
POLRMTO00411 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
POLRMTO00411 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
POLRMTO00411 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
POLRMTO00411 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
POLRMTO00411 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
POLRMTO00411 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
POLRMTO00411 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
POLRMTO00411 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
POLRMTO00411 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
POLRMTO00411 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
POLRMTO00411 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
POLRMTO00411 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
POLRMTO00411 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
POLRMTO00411 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
POLRMTO00411 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
POLRMTO00411 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
POLRMTO00411 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
POLRMTO00411 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
POLRMTO00411 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
POLRMTO00411 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
POLRMTO00411 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
POLRMTO00411 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
POLRMTO00411 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
POLRMTO00411 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
POLRMTO00411 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
POLRMTO00411 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
POLRMTO00411 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
POLRMTO00411 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
POLRMTO00411 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
POLRMTO00411 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
POLRMTO00411 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
POLRMTO00411 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
POLRMTO00411 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
POLRMTO00411 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
POLRMTO00411 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
POLRMTO00411 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
POLRMTO00411 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
POLRMTO00411 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
POLRMTO00411 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
POLRMTO00411 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
POLRMTO00411 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
POLRMTO00411 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
POLRMTO00411 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
POLRMTO00411 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
POLRMTO00411 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
POLRMTO00411 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
POLRMTO00411 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
POLRMTO00411 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
POLRMTO00411 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
POLRMTO00411 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
POLRMTO00411 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
POLRMTO00411 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
POLRMTO00411 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
POLRMTO00411 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
POLRMTO00411 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
POLRMTO00411 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
POLRMTO00411 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
POLRMTO00411 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
POLRMTO00411 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
POLRMTO00411 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms