Protein–RNA interactions for Protein: C9JE40

PATL2, Protein PAT1 homolog 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PATL2C9JE40 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PATL2C9JE40 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PATL2C9JE40 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PATL2C9JE40 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PATL2C9JE40 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PATL2C9JE40 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PATL2C9JE40 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PATL2C9JE40 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PATL2C9JE40 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PATL2C9JE40 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PATL2C9JE40 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PATL2C9JE40 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PATL2C9JE40 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PATL2C9JE40 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PATL2C9JE40 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PATL2C9JE40 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PATL2C9JE40 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PATL2C9JE40 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PATL2C9JE40 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PATL2C9JE40 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
PATL2C9JE40 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
PATL2C9JE40 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PATL2C9JE40 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PATL2C9JE40 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PATL2C9JE40 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PATL2C9JE40 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PATL2C9JE40 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PATL2C9JE40 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PATL2C9JE40 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PATL2C9JE40 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PATL2C9JE40 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PATL2C9JE40 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PATL2C9JE40 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PATL2C9JE40 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PATL2C9JE40 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PATL2C9JE40 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PATL2C9JE40 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PATL2C9JE40 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PATL2C9JE40 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
PATL2C9JE40 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PATL2C9JE40 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PATL2C9JE40 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PATL2C9JE40 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PATL2C9JE40 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PATL2C9JE40 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PATL2C9JE40 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PATL2C9JE40 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PATL2C9JE40 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PATL2C9JE40 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PATL2C9JE40 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PATL2C9JE40 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PATL2C9JE40 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PATL2C9JE40 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PATL2C9JE40 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PATL2C9JE40 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PATL2C9JE40 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
PATL2C9JE40 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PATL2C9JE40 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PATL2C9JE40 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PATL2C9JE40 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PATL2C9JE40 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PATL2C9JE40 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PATL2C9JE40 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PATL2C9JE40 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PATL2C9JE40 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PATL2C9JE40 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PATL2C9JE40 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PATL2C9JE40 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PATL2C9JE40 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PATL2C9JE40 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PATL2C9JE40 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PATL2C9JE40 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PATL2C9JE40 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PATL2C9JE40 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PATL2C9JE40 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PATL2C9JE40 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PATL2C9JE40 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PATL2C9JE40 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PATL2C9JE40 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
PATL2C9JE40 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PATL2C9JE40 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
PATL2C9JE40 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PATL2C9JE40 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PATL2C9JE40 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PATL2C9JE40 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PATL2C9JE40 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PATL2C9JE40 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PATL2C9JE40 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PATL2C9JE40 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PATL2C9JE40 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PATL2C9JE40 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PATL2C9JE40 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PATL2C9JE40 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PATL2C9JE40 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PATL2C9JE40 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PATL2C9JE40 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PATL2C9JE40 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PATL2C9JE40 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PATL2C9JE40 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PATL2C9JE40 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms