Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH9

ERVV-2, Endogenous retrovirus group V member 2 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-2B6SEH9 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ERVV-2B6SEH9 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ERVV-2B6SEH9 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ERVV-2B6SEH9 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ERVV-2B6SEH9 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ERVV-2B6SEH9 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ERVV-2B6SEH9 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ERVV-2B6SEH9 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ERVV-2B6SEH9 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ERVV-2B6SEH9 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ERVV-2B6SEH9 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ERVV-2B6SEH9 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ERVV-2B6SEH9 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ERVV-2B6SEH9 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ERVV-2B6SEH9 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ERVV-2B6SEH9 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ERVV-2B6SEH9 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ERVV-2B6SEH9 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ERVV-2B6SEH9 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ERVV-2B6SEH9 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ERVV-2B6SEH9 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
ERVV-2B6SEH9 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ERVV-2B6SEH9 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ERVV-2B6SEH9 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ERVV-2B6SEH9 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ERVV-2B6SEH9 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ERVV-2B6SEH9 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ERVV-2B6SEH9 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ERVV-2B6SEH9 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ERVV-2B6SEH9 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ERVV-2B6SEH9 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ERVV-2B6SEH9 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ERVV-2B6SEH9 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ERVV-2B6SEH9 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ERVV-2B6SEH9 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
ERVV-2B6SEH9 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ERVV-2B6SEH9 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ERVV-2B6SEH9 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
ERVV-2B6SEH9 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ERVV-2B6SEH9 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ERVV-2B6SEH9 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ERVV-2B6SEH9 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ERVV-2B6SEH9 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ERVV-2B6SEH9 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ERVV-2B6SEH9 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ERVV-2B6SEH9 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ERVV-2B6SEH9 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ERVV-2B6SEH9 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ERVV-2B6SEH9 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ERVV-2B6SEH9 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ERVV-2B6SEH9 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ERVV-2B6SEH9 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ERVV-2B6SEH9 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ERVV-2B6SEH9 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ERVV-2B6SEH9 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ERVV-2B6SEH9 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ERVV-2B6SEH9 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ERVV-2B6SEH9 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
ERVV-2B6SEH9 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
ERVV-2B6SEH9 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ERVV-2B6SEH9 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ERVV-2B6SEH9 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ERVV-2B6SEH9 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
ERVV-2B6SEH9 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
ERVV-2B6SEH9 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ERVV-2B6SEH9 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ERVV-2B6SEH9 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ERVV-2B6SEH9 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ERVV-2B6SEH9 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ERVV-2B6SEH9 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ERVV-2B6SEH9 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ERVV-2B6SEH9 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ERVV-2B6SEH9 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ERVV-2B6SEH9 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ERVV-2B6SEH9 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ERVV-2B6SEH9 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ERVV-2B6SEH9 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ERVV-2B6SEH9 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ERVV-2B6SEH9 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ERVV-2B6SEH9 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ERVV-2B6SEH9 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ERVV-2B6SEH9 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ERVV-2B6SEH9 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
ERVV-2B6SEH9 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
ERVV-2B6SEH9 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ERVV-2B6SEH9 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ERVV-2B6SEH9 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ERVV-2B6SEH9 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
ERVV-2B6SEH9 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ERVV-2B6SEH9 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ERVV-2B6SEH9 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ERVV-2B6SEH9 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ERVV-2B6SEH9 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ERVV-2B6SEH9 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ERVV-2B6SEH9 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ERVV-2B6SEH9 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ERVV-2B6SEH9 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ERVV-2B6SEH9 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ERVV-2B6SEH9 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ERVV-2B6SEH9 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms