Protein–RNA interactions for Protein: A8MTQ0

NOTO, Homeobox protein notochord, humanhuman

Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOTOA8MTQ0 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NOTOA8MTQ0 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NOTOA8MTQ0 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
NOTOA8MTQ0 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
NOTOA8MTQ0 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
NOTOA8MTQ0 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
NOTOA8MTQ0 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NOTOA8MTQ0 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
NOTOA8MTQ0 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NOTOA8MTQ0 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
NOTOA8MTQ0 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NOTOA8MTQ0 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NOTOA8MTQ0 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
NOTOA8MTQ0 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
NOTOA8MTQ0 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NOTOA8MTQ0 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NOTOA8MTQ0 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NOTOA8MTQ0 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NOTOA8MTQ0 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NOTOA8MTQ0 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
NOTOA8MTQ0 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NOTOA8MTQ0 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NOTOA8MTQ0 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NOTOA8MTQ0 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NOTOA8MTQ0 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NOTOA8MTQ0 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NOTOA8MTQ0 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NOTOA8MTQ0 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NOTOA8MTQ0 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NOTOA8MTQ0 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
NOTOA8MTQ0 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NOTOA8MTQ0 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NOTOA8MTQ0 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NOTOA8MTQ0 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NOTOA8MTQ0 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NOTOA8MTQ0 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
NOTOA8MTQ0 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NOTOA8MTQ0 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NOTOA8MTQ0 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NOTOA8MTQ0 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NOTOA8MTQ0 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NOTOA8MTQ0 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NOTOA8MTQ0 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NOTOA8MTQ0 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NOTOA8MTQ0 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NOTOA8MTQ0 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NOTOA8MTQ0 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NOTOA8MTQ0 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NOTOA8MTQ0 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NOTOA8MTQ0 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NOTOA8MTQ0 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NOTOA8MTQ0 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NOTOA8MTQ0 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NOTOA8MTQ0 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NOTOA8MTQ0 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NOTOA8MTQ0 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NOTOA8MTQ0 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NOTOA8MTQ0 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NOTOA8MTQ0 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NOTOA8MTQ0 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NOTOA8MTQ0 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NOTOA8MTQ0 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NOTOA8MTQ0 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NOTOA8MTQ0 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NOTOA8MTQ0 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NOTOA8MTQ0 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NOTOA8MTQ0 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NOTOA8MTQ0 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NOTOA8MTQ0 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NOTOA8MTQ0 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NOTOA8MTQ0 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NOTOA8MTQ0 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NOTOA8MTQ0 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NOTOA8MTQ0 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NOTOA8MTQ0 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NOTOA8MTQ0 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NOTOA8MTQ0 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NOTOA8MTQ0 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NOTOA8MTQ0 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC16■□□□□ 0.15
NOTOA8MTQ0 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NOTOA8MTQ0 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
NOTOA8MTQ0 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC16■□□□□ 0.15
NOTOA8MTQ0 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NOTOA8MTQ0 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NOTOA8MTQ0 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NOTOA8MTQ0 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NOTOA8MTQ0 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NOTOA8MTQ0 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NOTOA8MTQ0 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NOTOA8MTQ0 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NOTOA8MTQ0 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NOTOA8MTQ0 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NOTOA8MTQ0 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NOTOA8MTQ0 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NOTOA8MTQ0 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NOTOA8MTQ0 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NOTOA8MTQ0 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NOTOA8MTQ0 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC16■□□□□ 0.15
NOTOA8MTQ0 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NOTOA8MTQ0 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.9 ms