Protein–RNA interactions for Protein: A6NDR6

MEIS3P1, Putative homeobox protein Meis3-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEIS3P1A6NDR6 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MEIS3P1A6NDR6 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MEIS3P1A6NDR6 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MEIS3P1A6NDR6 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MEIS3P1A6NDR6 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MEIS3P1A6NDR6 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MEIS3P1A6NDR6 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MEIS3P1A6NDR6 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MEIS3P1A6NDR6 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MEIS3P1A6NDR6 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MEIS3P1A6NDR6 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MEIS3P1A6NDR6 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MEIS3P1A6NDR6 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
MEIS3P1A6NDR6 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MEIS3P1A6NDR6 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MEIS3P1A6NDR6 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MEIS3P1A6NDR6 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MEIS3P1A6NDR6 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MEIS3P1A6NDR6 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MEIS3P1A6NDR6 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MEIS3P1A6NDR6 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MEIS3P1A6NDR6 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
MEIS3P1A6NDR6 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
MEIS3P1A6NDR6 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MEIS3P1A6NDR6 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MEIS3P1A6NDR6 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MEIS3P1A6NDR6 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MEIS3P1A6NDR6 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MEIS3P1A6NDR6 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MEIS3P1A6NDR6 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MEIS3P1A6NDR6 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MEIS3P1A6NDR6 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MEIS3P1A6NDR6 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MEIS3P1A6NDR6 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MEIS3P1A6NDR6 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MEIS3P1A6NDR6 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MEIS3P1A6NDR6 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MEIS3P1A6NDR6 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MEIS3P1A6NDR6 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MEIS3P1A6NDR6 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MEIS3P1A6NDR6 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MEIS3P1A6NDR6 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MEIS3P1A6NDR6 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MEIS3P1A6NDR6 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MEIS3P1A6NDR6 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MEIS3P1A6NDR6 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MEIS3P1A6NDR6 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MEIS3P1A6NDR6 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MEIS3P1A6NDR6 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MEIS3P1A6NDR6 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MEIS3P1A6NDR6 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MEIS3P1A6NDR6 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MEIS3P1A6NDR6 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MEIS3P1A6NDR6 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MEIS3P1A6NDR6 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MEIS3P1A6NDR6 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MEIS3P1A6NDR6 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MEIS3P1A6NDR6 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MEIS3P1A6NDR6 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MEIS3P1A6NDR6 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MEIS3P1A6NDR6 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MEIS3P1A6NDR6 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MEIS3P1A6NDR6 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MEIS3P1A6NDR6 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MEIS3P1A6NDR6 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MEIS3P1A6NDR6 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MEIS3P1A6NDR6 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MEIS3P1A6NDR6 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MEIS3P1A6NDR6 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MEIS3P1A6NDR6 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MEIS3P1A6NDR6 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MEIS3P1A6NDR6 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MEIS3P1A6NDR6 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MEIS3P1A6NDR6 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MEIS3P1A6NDR6 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MEIS3P1A6NDR6 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MEIS3P1A6NDR6 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MEIS3P1A6NDR6 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MEIS3P1A6NDR6 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MEIS3P1A6NDR6 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MEIS3P1A6NDR6 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MEIS3P1A6NDR6 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MEIS3P1A6NDR6 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MEIS3P1A6NDR6 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MEIS3P1A6NDR6 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MEIS3P1A6NDR6 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MEIS3P1A6NDR6 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MEIS3P1A6NDR6 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MEIS3P1A6NDR6 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MEIS3P1A6NDR6 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MEIS3P1A6NDR6 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MEIS3P1A6NDR6 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MEIS3P1A6NDR6 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MEIS3P1A6NDR6 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
MEIS3P1A6NDR6 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
MEIS3P1A6NDR6 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MEIS3P1A6NDR6 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MEIS3P1A6NDR6 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MEIS3P1A6NDR6 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MEIS3P1A6NDR6 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms