Protein–RNA interactions for Protein: A5PKW4

PSD, PH and SEC7 domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSDA5PKW4 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PSDA5PKW4 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PSDA5PKW4 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PSDA5PKW4 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PSDA5PKW4 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PSDA5PKW4 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PSDA5PKW4 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
PSDA5PKW4 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
PSDA5PKW4 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PSDA5PKW4 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PSDA5PKW4 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PSDA5PKW4 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
PSDA5PKW4 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PSDA5PKW4 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PSDA5PKW4 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PSDA5PKW4 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PSDA5PKW4 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PSDA5PKW4 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PSDA5PKW4 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
PSDA5PKW4 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
PSDA5PKW4 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
PSDA5PKW4 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
PSDA5PKW4 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PSDA5PKW4 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PSDA5PKW4 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PSDA5PKW4 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PSDA5PKW4 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PSDA5PKW4 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
PSDA5PKW4 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PSDA5PKW4 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PSDA5PKW4 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PSDA5PKW4 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PSDA5PKW4 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PSDA5PKW4 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PSDA5PKW4 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PSDA5PKW4 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PSDA5PKW4 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PSDA5PKW4 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PSDA5PKW4 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PSDA5PKW4 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
PSDA5PKW4 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PSDA5PKW4 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PSDA5PKW4 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PSDA5PKW4 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PSDA5PKW4 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PSDA5PKW4 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PSDA5PKW4 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PSDA5PKW4 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PSDA5PKW4 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PSDA5PKW4 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PSDA5PKW4 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PSDA5PKW4 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PSDA5PKW4 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
PSDA5PKW4 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
PSDA5PKW4 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
PSDA5PKW4 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PSDA5PKW4 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PSDA5PKW4 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PSDA5PKW4 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PSDA5PKW4 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PSDA5PKW4 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PSDA5PKW4 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PSDA5PKW4 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PSDA5PKW4 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
PSDA5PKW4 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PSDA5PKW4 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PSDA5PKW4 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PSDA5PKW4 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
PSDA5PKW4 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PSDA5PKW4 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PSDA5PKW4 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PSDA5PKW4 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PSDA5PKW4 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PSDA5PKW4 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PSDA5PKW4 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PSDA5PKW4 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PSDA5PKW4 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PSDA5PKW4 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PSDA5PKW4 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PSDA5PKW4 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PSDA5PKW4 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PSDA5PKW4 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PSDA5PKW4 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PSDA5PKW4 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PSDA5PKW4 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PSDA5PKW4 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PSDA5PKW4 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PSDA5PKW4 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PSDA5PKW4 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PSDA5PKW4 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PSDA5PKW4 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
PSDA5PKW4 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PSDA5PKW4 SNX12-206ENST00000622259 661 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PSDA5PKW4 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
PSDA5PKW4 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PSDA5PKW4 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PSDA5PKW4 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PSDA5PKW4 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PSDA5PKW4 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PSDA5PKW4 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms