Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3Q4

HCN4, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 4, humanhuman

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Length 1,203 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCN4Q9Y3Q4 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HCN4Q9Y3Q4 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HCN4Q9Y3Q4 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HCN4Q9Y3Q4 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HCN4Q9Y3Q4 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HCN4Q9Y3Q4 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
HCN4Q9Y3Q4 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HCN4Q9Y3Q4 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HCN4Q9Y3Q4 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HCN4Q9Y3Q4 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HCN4Q9Y3Q4 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HCN4Q9Y3Q4 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HCN4Q9Y3Q4 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HCN4Q9Y3Q4 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HCN4Q9Y3Q4 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HCN4Q9Y3Q4 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HCN4Q9Y3Q4 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HCN4Q9Y3Q4 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HCN4Q9Y3Q4 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HCN4Q9Y3Q4 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
HCN4Q9Y3Q4 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HCN4Q9Y3Q4 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HCN4Q9Y3Q4 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HCN4Q9Y3Q4 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HCN4Q9Y3Q4 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HCN4Q9Y3Q4 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HCN4Q9Y3Q4 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
HCN4Q9Y3Q4 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
HCN4Q9Y3Q4 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HCN4Q9Y3Q4 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HCN4Q9Y3Q4 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HCN4Q9Y3Q4 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HCN4Q9Y3Q4 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HCN4Q9Y3Q4 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HCN4Q9Y3Q4 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HCN4Q9Y3Q4 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HCN4Q9Y3Q4 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HCN4Q9Y3Q4 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HCN4Q9Y3Q4 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HCN4Q9Y3Q4 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
HCN4Q9Y3Q4 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HCN4Q9Y3Q4 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
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HCN4Q9Y3Q4 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HCN4Q9Y3Q4 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
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HCN4Q9Y3Q4 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HCN4Q9Y3Q4 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HCN4Q9Y3Q4 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HCN4Q9Y3Q4 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
HCN4Q9Y3Q4 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
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HCN4Q9Y3Q4 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HCN4Q9Y3Q4 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HCN4Q9Y3Q4 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
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HCN4Q9Y3Q4 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HCN4Q9Y3Q4 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HCN4Q9Y3Q4 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HCN4Q9Y3Q4 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HCN4Q9Y3Q4 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HCN4Q9Y3Q4 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HCN4Q9Y3Q4 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HCN4Q9Y3Q4 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HCN4Q9Y3Q4 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
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HCN4Q9Y3Q4 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HCN4Q9Y3Q4 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
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HCN4Q9Y3Q4 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
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HCN4Q9Y3Q4 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
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HCN4Q9Y3Q4 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HCN4Q9Y3Q4 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HCN4Q9Y3Q4 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HCN4Q9Y3Q4 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HCN4Q9Y3Q4 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HCN4Q9Y3Q4 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HCN4Q9Y3Q4 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HCN4Q9Y3Q4 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HCN4Q9Y3Q4 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HCN4Q9Y3Q4 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
HCN4Q9Y3Q4 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HCN4Q9Y3Q4 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
HCN4Q9Y3Q4 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HCN4Q9Y3Q4 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HCN4Q9Y3Q4 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HCN4Q9Y3Q4 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HCN4Q9Y3Q4 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HCN4Q9Y3Q4 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HCN4Q9Y3Q4 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HCN4Q9Y3Q4 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HCN4Q9Y3Q4 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
HCN4Q9Y3Q4 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HCN4Q9Y3Q4 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
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