Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2K7

KDM2A, Lysine-specific demethylase 2A, humanhuman

Predictions only

Length 1,162 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM2AQ9Y2K7 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
KDM2AQ9Y2K7 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
KDM2AQ9Y2K7 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
KDM2AQ9Y2K7 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
KDM2AQ9Y2K7 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
KDM2AQ9Y2K7 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
KDM2AQ9Y2K7 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
KDM2AQ9Y2K7 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
KDM2AQ9Y2K7 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
KDM2AQ9Y2K7 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
KDM2AQ9Y2K7 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
KDM2AQ9Y2K7 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
KDM2AQ9Y2K7 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
KDM2AQ9Y2K7 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
KDM2AQ9Y2K7 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
KDM2AQ9Y2K7 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
KDM2AQ9Y2K7 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
KDM2AQ9Y2K7 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
KDM2AQ9Y2K7 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
KDM2AQ9Y2K7 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
KDM2AQ9Y2K7 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
KDM2AQ9Y2K7 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
KDM2AQ9Y2K7 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
KDM2AQ9Y2K7 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
KDM2AQ9Y2K7 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
KDM2AQ9Y2K7 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
KDM2AQ9Y2K7 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
KDM2AQ9Y2K7 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC25.73■■□□□ 1.71
KDM2AQ9Y2K7 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
KDM2AQ9Y2K7 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
KDM2AQ9Y2K7 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
KDM2AQ9Y2K7 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
KDM2AQ9Y2K7 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC25.73■■□□□ 1.71
KDM2AQ9Y2K7 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
KDM2AQ9Y2K7 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
KDM2AQ9Y2K7 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
KDM2AQ9Y2K7 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
KDM2AQ9Y2K7 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
KDM2AQ9Y2K7 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
KDM2AQ9Y2K7 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
KDM2AQ9Y2K7 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
KDM2AQ9Y2K7 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
KDM2AQ9Y2K7 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
KDM2AQ9Y2K7 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
KDM2AQ9Y2K7 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
KDM2AQ9Y2K7 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
KDM2AQ9Y2K7 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
KDM2AQ9Y2K7 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
KDM2AQ9Y2K7 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
KDM2AQ9Y2K7 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
KDM2AQ9Y2K7 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
KDM2AQ9Y2K7 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
KDM2AQ9Y2K7 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
KDM2AQ9Y2K7 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
KDM2AQ9Y2K7 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
KDM2AQ9Y2K7 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
KDM2AQ9Y2K7 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
KDM2AQ9Y2K7 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
KDM2AQ9Y2K7 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
KDM2AQ9Y2K7 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
KDM2AQ9Y2K7 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
KDM2AQ9Y2K7 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
KDM2AQ9Y2K7 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
KDM2AQ9Y2K7 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
KDM2AQ9Y2K7 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
KDM2AQ9Y2K7 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
KDM2AQ9Y2K7 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
KDM2AQ9Y2K7 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
KDM2AQ9Y2K7 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
KDM2AQ9Y2K7 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
KDM2AQ9Y2K7 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
KDM2AQ9Y2K7 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
KDM2AQ9Y2K7 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
KDM2AQ9Y2K7 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
KDM2AQ9Y2K7 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
KDM2AQ9Y2K7 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
KDM2AQ9Y2K7 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
KDM2AQ9Y2K7 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
KDM2AQ9Y2K7 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
KDM2AQ9Y2K7 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
KDM2AQ9Y2K7 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
KDM2AQ9Y2K7 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
KDM2AQ9Y2K7 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
KDM2AQ9Y2K7 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
KDM2AQ9Y2K7 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
KDM2AQ9Y2K7 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
KDM2AQ9Y2K7 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
KDM2AQ9Y2K7 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
KDM2AQ9Y2K7 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
KDM2AQ9Y2K7 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
KDM2AQ9Y2K7 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
KDM2AQ9Y2K7 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
KDM2AQ9Y2K7 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
KDM2AQ9Y2K7 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
KDM2AQ9Y2K7 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
KDM2AQ9Y2K7 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
KDM2AQ9Y2K7 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
KDM2AQ9Y2K7 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
KDM2AQ9Y2K7 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
KDM2AQ9Y2K7 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms