Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2D1

ATF5, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF5Q9Y2D1 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATF5Q9Y2D1 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATF5Q9Y2D1 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATF5Q9Y2D1 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATF5Q9Y2D1 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATF5Q9Y2D1 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATF5Q9Y2D1 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATF5Q9Y2D1 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATF5Q9Y2D1 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATF5Q9Y2D1 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATF5Q9Y2D1 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATF5Q9Y2D1 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATF5Q9Y2D1 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATF5Q9Y2D1 AC079349.1-201ENST00000509096 589 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATF5Q9Y2D1 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATF5Q9Y2D1 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
ATF5Q9Y2D1 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
ATF5Q9Y2D1 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATF5Q9Y2D1 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATF5Q9Y2D1 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATF5Q9Y2D1 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATF5Q9Y2D1 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATF5Q9Y2D1 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATF5Q9Y2D1 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATF5Q9Y2D1 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATF5Q9Y2D1 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATF5Q9Y2D1 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATF5Q9Y2D1 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATF5Q9Y2D1 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATF5Q9Y2D1 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATF5Q9Y2D1 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATF5Q9Y2D1 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATF5Q9Y2D1 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATF5Q9Y2D1 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATF5Q9Y2D1 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATF5Q9Y2D1 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATF5Q9Y2D1 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATF5Q9Y2D1 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATF5Q9Y2D1 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATF5Q9Y2D1 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATF5Q9Y2D1 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATF5Q9Y2D1 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
ATF5Q9Y2D1 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATF5Q9Y2D1 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATF5Q9Y2D1 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATF5Q9Y2D1 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATF5Q9Y2D1 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATF5Q9Y2D1 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATF5Q9Y2D1 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATF5Q9Y2D1 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATF5Q9Y2D1 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ATF5Q9Y2D1 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ATF5Q9Y2D1 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ATF5Q9Y2D1 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ATF5Q9Y2D1 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ATF5Q9Y2D1 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ATF5Q9Y2D1 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ATF5Q9Y2D1 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ATF5Q9Y2D1 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
ATF5Q9Y2D1 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ATF5Q9Y2D1 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ATF5Q9Y2D1 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ATF5Q9Y2D1 PMCHL1-203ENST00000423301 697 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ATF5Q9Y2D1 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ATF5Q9Y2D1 AL139353.2-202ENST00000502430 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ATF5Q9Y2D1 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ATF5Q9Y2D1 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ATF5Q9Y2D1 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
ATF5Q9Y2D1 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
ATF5Q9Y2D1 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ATF5Q9Y2D1 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
ATF5Q9Y2D1 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
ATF5Q9Y2D1 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATF5Q9Y2D1 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATF5Q9Y2D1 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
ATF5Q9Y2D1 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATF5Q9Y2D1 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATF5Q9Y2D1 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATF5Q9Y2D1 LRRIQ3-202ENST00000370909 793 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATF5Q9Y2D1 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATF5Q9Y2D1 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATF5Q9Y2D1 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATF5Q9Y2D1 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
ATF5Q9Y2D1 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATF5Q9Y2D1 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATF5Q9Y2D1 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
ATF5Q9Y2D1 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
ATF5Q9Y2D1 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATF5Q9Y2D1 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATF5Q9Y2D1 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATF5Q9Y2D1 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATF5Q9Y2D1 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATF5Q9Y2D1 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATF5Q9Y2D1 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATF5Q9Y2D1 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATF5Q9Y2D1 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATF5Q9Y2D1 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATF5Q9Y2D1 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATF5Q9Y2D1 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATF5Q9Y2D1 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms