Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQ13

SHOC2, Leucine-rich repeat protein SHOC-2, humanhuman

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Length 582 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHOC2Q9UQ13 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
SHOC2Q9UQ13 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SHOC2Q9UQ13 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SHOC2Q9UQ13 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SHOC2Q9UQ13 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SHOC2Q9UQ13 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SHOC2Q9UQ13 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SHOC2Q9UQ13 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SHOC2Q9UQ13 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SHOC2Q9UQ13 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SHOC2Q9UQ13 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SHOC2Q9UQ13 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SHOC2Q9UQ13 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SHOC2Q9UQ13 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SHOC2Q9UQ13 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SHOC2Q9UQ13 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SHOC2Q9UQ13 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SHOC2Q9UQ13 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SHOC2Q9UQ13 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SHOC2Q9UQ13 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SHOC2Q9UQ13 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SHOC2Q9UQ13 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SHOC2Q9UQ13 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SHOC2Q9UQ13 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SHOC2Q9UQ13 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SHOC2Q9UQ13 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SHOC2Q9UQ13 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
SHOC2Q9UQ13 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SHOC2Q9UQ13 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SHOC2Q9UQ13 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SHOC2Q9UQ13 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
SHOC2Q9UQ13 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
SHOC2Q9UQ13 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SHOC2Q9UQ13 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SHOC2Q9UQ13 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SHOC2Q9UQ13 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
SHOC2Q9UQ13 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SHOC2Q9UQ13 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SHOC2Q9UQ13 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SHOC2Q9UQ13 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SHOC2Q9UQ13 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SHOC2Q9UQ13 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SHOC2Q9UQ13 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SHOC2Q9UQ13 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SHOC2Q9UQ13 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SHOC2Q9UQ13 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SHOC2Q9UQ13 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SHOC2Q9UQ13 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SHOC2Q9UQ13 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SHOC2Q9UQ13 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SHOC2Q9UQ13 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SHOC2Q9UQ13 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SHOC2Q9UQ13 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SHOC2Q9UQ13 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SHOC2Q9UQ13 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
SHOC2Q9UQ13 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SHOC2Q9UQ13 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SHOC2Q9UQ13 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SHOC2Q9UQ13 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SHOC2Q9UQ13 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SHOC2Q9UQ13 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SHOC2Q9UQ13 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SHOC2Q9UQ13 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SHOC2Q9UQ13 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SHOC2Q9UQ13 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SHOC2Q9UQ13 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
SHOC2Q9UQ13 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SHOC2Q9UQ13 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SHOC2Q9UQ13 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
SHOC2Q9UQ13 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SHOC2Q9UQ13 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SHOC2Q9UQ13 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SHOC2Q9UQ13 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SHOC2Q9UQ13 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SHOC2Q9UQ13 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SHOC2Q9UQ13 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SHOC2Q9UQ13 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
SHOC2Q9UQ13 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SHOC2Q9UQ13 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SHOC2Q9UQ13 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SHOC2Q9UQ13 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SHOC2Q9UQ13 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SHOC2Q9UQ13 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SHOC2Q9UQ13 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SHOC2Q9UQ13 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SHOC2Q9UQ13 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SHOC2Q9UQ13 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SHOC2Q9UQ13 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SHOC2Q9UQ13 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SHOC2Q9UQ13 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SHOC2Q9UQ13 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SHOC2Q9UQ13 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SHOC2Q9UQ13 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SHOC2Q9UQ13 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SHOC2Q9UQ13 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SHOC2Q9UQ13 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SHOC2Q9UQ13 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SHOC2Q9UQ13 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SHOC2Q9UQ13 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SHOC2Q9UQ13 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
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