Protein–RNA interactions for Protein: Q9UM73

ALK, ALK tyrosine kinase receptor, humanhuman

Predictions only

Length 1,620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALKQ9UM73 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
ALKQ9UM73 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ALKQ9UM73 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ALKQ9UM73 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
ALKQ9UM73 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ALKQ9UM73 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ALKQ9UM73 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ALKQ9UM73 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ALKQ9UM73 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ALKQ9UM73 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ALKQ9UM73 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ALKQ9UM73 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ALKQ9UM73 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ALKQ9UM73 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ALKQ9UM73 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ALKQ9UM73 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ALKQ9UM73 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ALKQ9UM73 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ALKQ9UM73 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ALKQ9UM73 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ALKQ9UM73 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ALKQ9UM73 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ALKQ9UM73 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ALKQ9UM73 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ALKQ9UM73 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ALKQ9UM73 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ALKQ9UM73 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ALKQ9UM73 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ALKQ9UM73 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
ALKQ9UM73 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ALKQ9UM73 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
ALKQ9UM73 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
ALKQ9UM73 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
ALKQ9UM73 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
ALKQ9UM73 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
ALKQ9UM73 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
ALKQ9UM73 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
ALKQ9UM73 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.65
ALKQ9UM73 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
ALKQ9UM73 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
ALKQ9UM73 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
ALKQ9UM73 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
ALKQ9UM73 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
ALKQ9UM73 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
ALKQ9UM73 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ALKQ9UM73 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ALKQ9UM73 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ALKQ9UM73 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ALKQ9UM73 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ALKQ9UM73 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ALKQ9UM73 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ALKQ9UM73 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ALKQ9UM73 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
ALKQ9UM73 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ALKQ9UM73 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ALKQ9UM73 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ALKQ9UM73 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ALKQ9UM73 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ALKQ9UM73 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ALKQ9UM73 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ALKQ9UM73 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ALKQ9UM73 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ALKQ9UM73 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
ALKQ9UM73 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
ALKQ9UM73 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ALKQ9UM73 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
ALKQ9UM73 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ALKQ9UM73 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
ALKQ9UM73 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ALKQ9UM73 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ALKQ9UM73 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ALKQ9UM73 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ALKQ9UM73 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
ALKQ9UM73 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ALKQ9UM73 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ALKQ9UM73 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ALKQ9UM73 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ALKQ9UM73 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ALKQ9UM73 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ALKQ9UM73 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ALKQ9UM73 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ALKQ9UM73 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ALKQ9UM73 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
ALKQ9UM73 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
ALKQ9UM73 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
ALKQ9UM73 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ALKQ9UM73 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ALKQ9UM73 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ALKQ9UM73 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ALKQ9UM73 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ALKQ9UM73 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ALKQ9UM73 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ALKQ9UM73 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ALKQ9UM73 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ALKQ9UM73 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ALKQ9UM73 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ALKQ9UM73 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ALKQ9UM73 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ALKQ9UM73 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ALKQ9UM73 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.5 ms