Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJY5

GGA1, ADP-ribosylation factor-binding protein GGA1, humanhuman

Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA1Q9UJY5 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GGA1Q9UJY5 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GGA1Q9UJY5 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GGA1Q9UJY5 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GGA1Q9UJY5 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GGA1Q9UJY5 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GGA1Q9UJY5 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GGA1Q9UJY5 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GGA1Q9UJY5 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GGA1Q9UJY5 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GGA1Q9UJY5 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GGA1Q9UJY5 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GGA1Q9UJY5 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GGA1Q9UJY5 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GGA1Q9UJY5 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GGA1Q9UJY5 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
GGA1Q9UJY5 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GGA1Q9UJY5 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GGA1Q9UJY5 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GGA1Q9UJY5 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GGA1Q9UJY5 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
GGA1Q9UJY5 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GGA1Q9UJY5 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GGA1Q9UJY5 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GGA1Q9UJY5 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GGA1Q9UJY5 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GGA1Q9UJY5 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GGA1Q9UJY5 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GGA1Q9UJY5 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GGA1Q9UJY5 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GGA1Q9UJY5 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GGA1Q9UJY5 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
GGA1Q9UJY5 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GGA1Q9UJY5 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GGA1Q9UJY5 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GGA1Q9UJY5 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GGA1Q9UJY5 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GGA1Q9UJY5 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GGA1Q9UJY5 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GGA1Q9UJY5 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GGA1Q9UJY5 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GGA1Q9UJY5 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GGA1Q9UJY5 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GGA1Q9UJY5 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GGA1Q9UJY5 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GGA1Q9UJY5 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GGA1Q9UJY5 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GGA1Q9UJY5 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GGA1Q9UJY5 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GGA1Q9UJY5 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GGA1Q9UJY5 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GGA1Q9UJY5 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GGA1Q9UJY5 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GGA1Q9UJY5 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GGA1Q9UJY5 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GGA1Q9UJY5 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GGA1Q9UJY5 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GGA1Q9UJY5 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GGA1Q9UJY5 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GGA1Q9UJY5 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GGA1Q9UJY5 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GGA1Q9UJY5 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GGA1Q9UJY5 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GGA1Q9UJY5 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GGA1Q9UJY5 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GGA1Q9UJY5 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GGA1Q9UJY5 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GGA1Q9UJY5 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GGA1Q9UJY5 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GGA1Q9UJY5 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GGA1Q9UJY5 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GGA1Q9UJY5 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GGA1Q9UJY5 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GGA1Q9UJY5 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GGA1Q9UJY5 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GGA1Q9UJY5 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GGA1Q9UJY5 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GGA1Q9UJY5 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GGA1Q9UJY5 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GGA1Q9UJY5 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GGA1Q9UJY5 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GGA1Q9UJY5 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GGA1Q9UJY5 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GGA1Q9UJY5 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GGA1Q9UJY5 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GGA1Q9UJY5 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
GGA1Q9UJY5 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
GGA1Q9UJY5 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GGA1Q9UJY5 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
GGA1Q9UJY5 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
GGA1Q9UJY5 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
GGA1Q9UJY5 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
GGA1Q9UJY5 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
GGA1Q9UJY5 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GGA1Q9UJY5 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GGA1Q9UJY5 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GGA1Q9UJY5 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GGA1Q9UJY5 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
GGA1Q9UJY5 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
GGA1Q9UJY5 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms