Protein–RNA interactions for Protein: Q9UII2

ATPIF1, ATPase inhibitor, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATPIF1Q9UII2 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATPIF1Q9UII2 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATPIF1Q9UII2 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATPIF1Q9UII2 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATPIF1Q9UII2 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ATPIF1Q9UII2 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATPIF1Q9UII2 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATPIF1Q9UII2 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATPIF1Q9UII2 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATPIF1Q9UII2 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ATPIF1Q9UII2 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATPIF1Q9UII2 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATPIF1Q9UII2 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATPIF1Q9UII2 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATPIF1Q9UII2 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATPIF1Q9UII2 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATPIF1Q9UII2 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATPIF1Q9UII2 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATPIF1Q9UII2 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATPIF1Q9UII2 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATPIF1Q9UII2 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATPIF1Q9UII2 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATPIF1Q9UII2 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATPIF1Q9UII2 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATPIF1Q9UII2 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATPIF1Q9UII2 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATPIF1Q9UII2 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATPIF1Q9UII2 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATPIF1Q9UII2 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATPIF1Q9UII2 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATPIF1Q9UII2 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATPIF1Q9UII2 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATPIF1Q9UII2 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATPIF1Q9UII2 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATPIF1Q9UII2 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATPIF1Q9UII2 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATPIF1Q9UII2 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATPIF1Q9UII2 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATPIF1Q9UII2 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATPIF1Q9UII2 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATPIF1Q9UII2 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATPIF1Q9UII2 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ATPIF1Q9UII2 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATPIF1Q9UII2 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ATPIF1Q9UII2 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATPIF1Q9UII2 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATPIF1Q9UII2 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATPIF1Q9UII2 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ATPIF1Q9UII2 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATPIF1Q9UII2 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATPIF1Q9UII2 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATPIF1Q9UII2 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATPIF1Q9UII2 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATPIF1Q9UII2 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATPIF1Q9UII2 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATPIF1Q9UII2 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATPIF1Q9UII2 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATPIF1Q9UII2 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATPIF1Q9UII2 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATPIF1Q9UII2 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATPIF1Q9UII2 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATPIF1Q9UII2 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATPIF1Q9UII2 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATPIF1Q9UII2 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATPIF1Q9UII2 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATPIF1Q9UII2 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATPIF1Q9UII2 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATPIF1Q9UII2 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATPIF1Q9UII2 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATPIF1Q9UII2 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ATPIF1Q9UII2 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATPIF1Q9UII2 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATPIF1Q9UII2 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATPIF1Q9UII2 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATPIF1Q9UII2 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATPIF1Q9UII2 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATPIF1Q9UII2 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATPIF1Q9UII2 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATPIF1Q9UII2 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATPIF1Q9UII2 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATPIF1Q9UII2 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATPIF1Q9UII2 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATPIF1Q9UII2 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATPIF1Q9UII2 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ATPIF1Q9UII2 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATPIF1Q9UII2 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ATPIF1Q9UII2 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATPIF1Q9UII2 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATPIF1Q9UII2 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ATPIF1Q9UII2 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATPIF1Q9UII2 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATPIF1Q9UII2 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATPIF1Q9UII2 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ATPIF1Q9UII2 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ATPIF1Q9UII2 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ATPIF1Q9UII2 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ATPIF1Q9UII2 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ATPIF1Q9UII2 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ATPIF1Q9UII2 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ATPIF1Q9UII2 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47 ms