Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBW8

COPS7A, COP9 signalosome complex subunit 7a, humanhuman

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Length 275 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS7AQ9UBW8 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
COPS7AQ9UBW8 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
COPS7AQ9UBW8 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
COPS7AQ9UBW8 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
COPS7AQ9UBW8 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
COPS7AQ9UBW8 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
COPS7AQ9UBW8 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
COPS7AQ9UBW8 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
COPS7AQ9UBW8 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
COPS7AQ9UBW8 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
COPS7AQ9UBW8 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
COPS7AQ9UBW8 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
COPS7AQ9UBW8 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
COPS7AQ9UBW8 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
COPS7AQ9UBW8 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
COPS7AQ9UBW8 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
COPS7AQ9UBW8 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
COPS7AQ9UBW8 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
COPS7AQ9UBW8 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
COPS7AQ9UBW8 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
COPS7AQ9UBW8 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
COPS7AQ9UBW8 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
COPS7AQ9UBW8 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
COPS7AQ9UBW8 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
COPS7AQ9UBW8 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
COPS7AQ9UBW8 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
COPS7AQ9UBW8 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
COPS7AQ9UBW8 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
COPS7AQ9UBW8 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
COPS7AQ9UBW8 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
COPS7AQ9UBW8 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
COPS7AQ9UBW8 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
COPS7AQ9UBW8 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
COPS7AQ9UBW8 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
COPS7AQ9UBW8 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
COPS7AQ9UBW8 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
COPS7AQ9UBW8 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
COPS7AQ9UBW8 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
COPS7AQ9UBW8 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
COPS7AQ9UBW8 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
COPS7AQ9UBW8 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC16.82■□□□□ 0.28
COPS7AQ9UBW8 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
COPS7AQ9UBW8 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
COPS7AQ9UBW8 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
COPS7AQ9UBW8 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
COPS7AQ9UBW8 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
COPS7AQ9UBW8 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
COPS7AQ9UBW8 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
COPS7AQ9UBW8 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
COPS7AQ9UBW8 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
COPS7AQ9UBW8 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
COPS7AQ9UBW8 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
COPS7AQ9UBW8 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
COPS7AQ9UBW8 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
COPS7AQ9UBW8 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
COPS7AQ9UBW8 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
COPS7AQ9UBW8 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
COPS7AQ9UBW8 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
COPS7AQ9UBW8 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
COPS7AQ9UBW8 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
COPS7AQ9UBW8 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
COPS7AQ9UBW8 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
COPS7AQ9UBW8 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
COPS7AQ9UBW8 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
COPS7AQ9UBW8 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
COPS7AQ9UBW8 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.81■□□□□ 0.28
COPS7AQ9UBW8 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
COPS7AQ9UBW8 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
COPS7AQ9UBW8 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
COPS7AQ9UBW8 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
COPS7AQ9UBW8 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
COPS7AQ9UBW8 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
COPS7AQ9UBW8 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
COPS7AQ9UBW8 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
COPS7AQ9UBW8 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
COPS7AQ9UBW8 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
COPS7AQ9UBW8 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
COPS7AQ9UBW8 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
COPS7AQ9UBW8 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
COPS7AQ9UBW8 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
COPS7AQ9UBW8 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
COPS7AQ9UBW8 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
COPS7AQ9UBW8 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
COPS7AQ9UBW8 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
COPS7AQ9UBW8 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
COPS7AQ9UBW8 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
COPS7AQ9UBW8 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
COPS7AQ9UBW8 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
COPS7AQ9UBW8 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
COPS7AQ9UBW8 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
COPS7AQ9UBW8 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
COPS7AQ9UBW8 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
COPS7AQ9UBW8 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
COPS7AQ9UBW8 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
COPS7AQ9UBW8 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
COPS7AQ9UBW8 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
COPS7AQ9UBW8 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
COPS7AQ9UBW8 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
COPS7AQ9UBW8 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
COPS7AQ9UBW8 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
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