Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBB5

MBD2, Methyl-CpG-binding domain protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD2Q9UBB5 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MBD2Q9UBB5 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
MBD2Q9UBB5 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MBD2Q9UBB5 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
MBD2Q9UBB5 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
MBD2Q9UBB5 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MBD2Q9UBB5 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MBD2Q9UBB5 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
MBD2Q9UBB5 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
MBD2Q9UBB5 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MBD2Q9UBB5 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
MBD2Q9UBB5 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MBD2Q9UBB5 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
MBD2Q9UBB5 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
MBD2Q9UBB5 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
MBD2Q9UBB5 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MBD2Q9UBB5 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
MBD2Q9UBB5 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MBD2Q9UBB5 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MBD2Q9UBB5 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
MBD2Q9UBB5 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
MBD2Q9UBB5 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MBD2Q9UBB5 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
MBD2Q9UBB5 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
MBD2Q9UBB5 AC138969.2-201ENST00000532739 9932 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
MBD2Q9UBB5 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MBD2Q9UBB5 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
MBD2Q9UBB5 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MBD2Q9UBB5 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MBD2Q9UBB5 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MBD2Q9UBB5 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
MBD2Q9UBB5 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MBD2Q9UBB5 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MBD2Q9UBB5 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MBD2Q9UBB5 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
MBD2Q9UBB5 PPM1A-203ENST00000395076 8184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MBD2Q9UBB5 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
MBD2Q9UBB5 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MBD2Q9UBB5 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MBD2Q9UBB5 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
MBD2Q9UBB5 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
MBD2Q9UBB5 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
MBD2Q9UBB5 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MBD2Q9UBB5 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MBD2Q9UBB5 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
MBD2Q9UBB5 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MBD2Q9UBB5 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
MBD2Q9UBB5 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MBD2Q9UBB5 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MBD2Q9UBB5 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MBD2Q9UBB5 RUNX1T1-251ENST00000615601 7372 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
MBD2Q9UBB5 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
MBD2Q9UBB5 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MBD2Q9UBB5 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MBD2Q9UBB5 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MBD2Q9UBB5 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
MBD2Q9UBB5 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MBD2Q9UBB5 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MBD2Q9UBB5 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
MBD2Q9UBB5 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MBD2Q9UBB5 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MBD2Q9UBB5 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MBD2Q9UBB5 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MBD2Q9UBB5 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
MBD2Q9UBB5 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MBD2Q9UBB5 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
MBD2Q9UBB5 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MBD2Q9UBB5 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
MBD2Q9UBB5 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
MBD2Q9UBB5 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MBD2Q9UBB5 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MBD2Q9UBB5 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MBD2Q9UBB5 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
MBD2Q9UBB5 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
MBD2Q9UBB5 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
MBD2Q9UBB5 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MBD2Q9UBB5 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
MBD2Q9UBB5 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MBD2Q9UBB5 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MBD2Q9UBB5 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
MBD2Q9UBB5 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MBD2Q9UBB5 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MBD2Q9UBB5 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
MBD2Q9UBB5 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MBD2Q9UBB5 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MBD2Q9UBB5 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
MBD2Q9UBB5 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MBD2Q9UBB5 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
MBD2Q9UBB5 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
MBD2Q9UBB5 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MBD2Q9UBB5 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MBD2Q9UBB5 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MBD2Q9UBB5 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
MBD2Q9UBB5 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MBD2Q9UBB5 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MBD2Q9UBB5 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
MBD2Q9UBB5 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MBD2Q9UBB5 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MBD2Q9UBB5 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
MBD2Q9UBB5 TMEM200C-202ENST00000581347 10638 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms