Protein–RNA interactions for Protein: Q9P299

COPZ2, Coatomer subunit zeta-2, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPZ2Q9P299 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
COPZ2Q9P299 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
COPZ2Q9P299 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
COPZ2Q9P299 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
COPZ2Q9P299 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
COPZ2Q9P299 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
COPZ2Q9P299 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
COPZ2Q9P299 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
COPZ2Q9P299 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
COPZ2Q9P299 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
COPZ2Q9P299 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
COPZ2Q9P299 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
COPZ2Q9P299 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
COPZ2Q9P299 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
COPZ2Q9P299 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
COPZ2Q9P299 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
COPZ2Q9P299 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
COPZ2Q9P299 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
COPZ2Q9P299 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
COPZ2Q9P299 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
COPZ2Q9P299 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
COPZ2Q9P299 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
COPZ2Q9P299 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
COPZ2Q9P299 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
COPZ2Q9P299 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
COPZ2Q9P299 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
COPZ2Q9P299 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
COPZ2Q9P299 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
COPZ2Q9P299 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
COPZ2Q9P299 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
COPZ2Q9P299 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
COPZ2Q9P299 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
COPZ2Q9P299 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
COPZ2Q9P299 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
COPZ2Q9P299 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
COPZ2Q9P299 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
COPZ2Q9P299 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
COPZ2Q9P299 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
COPZ2Q9P299 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
COPZ2Q9P299 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
COPZ2Q9P299 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
COPZ2Q9P299 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
COPZ2Q9P299 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
COPZ2Q9P299 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
COPZ2Q9P299 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
COPZ2Q9P299 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
COPZ2Q9P299 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
COPZ2Q9P299 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
COPZ2Q9P299 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
COPZ2Q9P299 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
COPZ2Q9P299 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
COPZ2Q9P299 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
COPZ2Q9P299 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
COPZ2Q9P299 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
COPZ2Q9P299 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
COPZ2Q9P299 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
COPZ2Q9P299 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
COPZ2Q9P299 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
COPZ2Q9P299 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
COPZ2Q9P299 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
COPZ2Q9P299 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
COPZ2Q9P299 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
COPZ2Q9P299 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
COPZ2Q9P299 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
COPZ2Q9P299 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
COPZ2Q9P299 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
COPZ2Q9P299 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
COPZ2Q9P299 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
COPZ2Q9P299 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
COPZ2Q9P299 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
COPZ2Q9P299 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
COPZ2Q9P299 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
COPZ2Q9P299 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
COPZ2Q9P299 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
COPZ2Q9P299 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
COPZ2Q9P299 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
COPZ2Q9P299 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
COPZ2Q9P299 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
COPZ2Q9P299 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
COPZ2Q9P299 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
COPZ2Q9P299 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
COPZ2Q9P299 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
COPZ2Q9P299 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
COPZ2Q9P299 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
COPZ2Q9P299 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
COPZ2Q9P299 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
COPZ2Q9P299 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
COPZ2Q9P299 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
COPZ2Q9P299 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
COPZ2Q9P299 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
COPZ2Q9P299 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
COPZ2Q9P299 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
COPZ2Q9P299 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
COPZ2Q9P299 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
COPZ2Q9P299 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
COPZ2Q9P299 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
COPZ2Q9P299 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
COPZ2Q9P299 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
COPZ2Q9P299 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
COPZ2Q9P299 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms