Protein–RNA interactions for Protein: Q9P258

RCC2, Protein RCC2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCC2Q9P258 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RCC2Q9P258 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RCC2Q9P258 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RCC2Q9P258 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RCC2Q9P258 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RCC2Q9P258 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RCC2Q9P258 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RCC2Q9P258 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RCC2Q9P258 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RCC2Q9P258 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RCC2Q9P258 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RCC2Q9P258 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RCC2Q9P258 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RCC2Q9P258 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RCC2Q9P258 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RCC2Q9P258 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RCC2Q9P258 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RCC2Q9P258 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
RCC2Q9P258 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RCC2Q9P258 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
RCC2Q9P258 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RCC2Q9P258 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RCC2Q9P258 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RCC2Q9P258 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RCC2Q9P258 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
RCC2Q9P258 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RCC2Q9P258 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RCC2Q9P258 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
RCC2Q9P258 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RCC2Q9P258 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RCC2Q9P258 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RCC2Q9P258 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RCC2Q9P258 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RCC2Q9P258 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RCC2Q9P258 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RCC2Q9P258 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RCC2Q9P258 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RCC2Q9P258 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RCC2Q9P258 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
RCC2Q9P258 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RCC2Q9P258 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RCC2Q9P258 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RCC2Q9P258 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RCC2Q9P258 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RCC2Q9P258 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RCC2Q9P258 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RCC2Q9P258 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RCC2Q9P258 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RCC2Q9P258 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RCC2Q9P258 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RCC2Q9P258 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RCC2Q9P258 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RCC2Q9P258 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RCC2Q9P258 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RCC2Q9P258 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
RCC2Q9P258 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RCC2Q9P258 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RCC2Q9P258 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
RCC2Q9P258 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RCC2Q9P258 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RCC2Q9P258 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RCC2Q9P258 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RCC2Q9P258 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RCC2Q9P258 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
RCC2Q9P258 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RCC2Q9P258 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RCC2Q9P258 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RCC2Q9P258 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
RCC2Q9P258 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
RCC2Q9P258 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RCC2Q9P258 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RCC2Q9P258 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
RCC2Q9P258 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RCC2Q9P258 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RCC2Q9P258 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RCC2Q9P258 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RCC2Q9P258 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RCC2Q9P258 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RCC2Q9P258 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RCC2Q9P258 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
RCC2Q9P258 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RCC2Q9P258 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RCC2Q9P258 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RCC2Q9P258 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RCC2Q9P258 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RCC2Q9P258 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RCC2Q9P258 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RCC2Q9P258 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RCC2Q9P258 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RCC2Q9P258 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RCC2Q9P258 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RCC2Q9P258 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RCC2Q9P258 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RCC2Q9P258 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RCC2Q9P258 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RCC2Q9P258 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RCC2Q9P258 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RCC2Q9P258 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RCC2Q9P258 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RCC2Q9P258 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms