Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZR4

VSX1, Visual system homeobox 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSX1Q9NZR4 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VSX1Q9NZR4 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
VSX1Q9NZR4 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VSX1Q9NZR4 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VSX1Q9NZR4 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VSX1Q9NZR4 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
VSX1Q9NZR4 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
VSX1Q9NZR4 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
VSX1Q9NZR4 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
VSX1Q9NZR4 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
VSX1Q9NZR4 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
VSX1Q9NZR4 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VSX1Q9NZR4 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VSX1Q9NZR4 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VSX1Q9NZR4 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
VSX1Q9NZR4 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VSX1Q9NZR4 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
VSX1Q9NZR4 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VSX1Q9NZR4 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VSX1Q9NZR4 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
VSX1Q9NZR4 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
VSX1Q9NZR4 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VSX1Q9NZR4 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
VSX1Q9NZR4 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VSX1Q9NZR4 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
VSX1Q9NZR4 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VSX1Q9NZR4 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VSX1Q9NZR4 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VSX1Q9NZR4 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
VSX1Q9NZR4 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VSX1Q9NZR4 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
VSX1Q9NZR4 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
VSX1Q9NZR4 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
VSX1Q9NZR4 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
VSX1Q9NZR4 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
VSX1Q9NZR4 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
VSX1Q9NZR4 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
VSX1Q9NZR4 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
VSX1Q9NZR4 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
VSX1Q9NZR4 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
VSX1Q9NZR4 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
VSX1Q9NZR4 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
VSX1Q9NZR4 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
VSX1Q9NZR4 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
VSX1Q9NZR4 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
VSX1Q9NZR4 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
VSX1Q9NZR4 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
VSX1Q9NZR4 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
VSX1Q9NZR4 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
VSX1Q9NZR4 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
VSX1Q9NZR4 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
VSX1Q9NZR4 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
VSX1Q9NZR4 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
VSX1Q9NZR4 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
VSX1Q9NZR4 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
VSX1Q9NZR4 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
VSX1Q9NZR4 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
VSX1Q9NZR4 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
VSX1Q9NZR4 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
VSX1Q9NZR4 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
VSX1Q9NZR4 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
VSX1Q9NZR4 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
VSX1Q9NZR4 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
VSX1Q9NZR4 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
VSX1Q9NZR4 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
VSX1Q9NZR4 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
VSX1Q9NZR4 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
VSX1Q9NZR4 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
VSX1Q9NZR4 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
VSX1Q9NZR4 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
VSX1Q9NZR4 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
VSX1Q9NZR4 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
VSX1Q9NZR4 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VSX1Q9NZR4 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
VSX1Q9NZR4 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
VSX1Q9NZR4 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VSX1Q9NZR4 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
VSX1Q9NZR4 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
VSX1Q9NZR4 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VSX1Q9NZR4 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
VSX1Q9NZR4 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
VSX1Q9NZR4 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VSX1Q9NZR4 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VSX1Q9NZR4 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
VSX1Q9NZR4 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
VSX1Q9NZR4 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
VSX1Q9NZR4 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
VSX1Q9NZR4 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
VSX1Q9NZR4 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
VSX1Q9NZR4 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VSX1Q9NZR4 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VSX1Q9NZR4 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
VSX1Q9NZR4 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VSX1Q9NZR4 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
VSX1Q9NZR4 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
VSX1Q9NZR4 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VSX1Q9NZR4 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VSX1Q9NZR4 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VSX1Q9NZR4 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VSX1Q9NZR4 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms