Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZN3

EHD3, EH domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD3Q9NZN3 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
EHD3Q9NZN3 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
EHD3Q9NZN3 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
EHD3Q9NZN3 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
EHD3Q9NZN3 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
EHD3Q9NZN3 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
EHD3Q9NZN3 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
EHD3Q9NZN3 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
EHD3Q9NZN3 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
EHD3Q9NZN3 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
EHD3Q9NZN3 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
EHD3Q9NZN3 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
EHD3Q9NZN3 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
EHD3Q9NZN3 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
EHD3Q9NZN3 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
EHD3Q9NZN3 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
EHD3Q9NZN3 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
EHD3Q9NZN3 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
EHD3Q9NZN3 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
EHD3Q9NZN3 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
EHD3Q9NZN3 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
EHD3Q9NZN3 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
EHD3Q9NZN3 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
EHD3Q9NZN3 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
EHD3Q9NZN3 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
EHD3Q9NZN3 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
EHD3Q9NZN3 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.26■□□□□ 0.35
EHD3Q9NZN3 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
EHD3Q9NZN3 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
EHD3Q9NZN3 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
EHD3Q9NZN3 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
EHD3Q9NZN3 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
EHD3Q9NZN3 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
EHD3Q9NZN3 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
EHD3Q9NZN3 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
EHD3Q9NZN3 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
EHD3Q9NZN3 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
EHD3Q9NZN3 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
EHD3Q9NZN3 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
EHD3Q9NZN3 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
EHD3Q9NZN3 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
EHD3Q9NZN3 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
EHD3Q9NZN3 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
EHD3Q9NZN3 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
EHD3Q9NZN3 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
EHD3Q9NZN3 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
EHD3Q9NZN3 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
EHD3Q9NZN3 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
EHD3Q9NZN3 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
EHD3Q9NZN3 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
EHD3Q9NZN3 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
EHD3Q9NZN3 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
EHD3Q9NZN3 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
EHD3Q9NZN3 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
EHD3Q9NZN3 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
EHD3Q9NZN3 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
EHD3Q9NZN3 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
EHD3Q9NZN3 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
EHD3Q9NZN3 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
EHD3Q9NZN3 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
EHD3Q9NZN3 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
EHD3Q9NZN3 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
EHD3Q9NZN3 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
EHD3Q9NZN3 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
EHD3Q9NZN3 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
EHD3Q9NZN3 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
EHD3Q9NZN3 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
EHD3Q9NZN3 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
EHD3Q9NZN3 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
EHD3Q9NZN3 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
EHD3Q9NZN3 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
EHD3Q9NZN3 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
EHD3Q9NZN3 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
EHD3Q9NZN3 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
EHD3Q9NZN3 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
EHD3Q9NZN3 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
EHD3Q9NZN3 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
EHD3Q9NZN3 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
EHD3Q9NZN3 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
EHD3Q9NZN3 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
EHD3Q9NZN3 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
EHD3Q9NZN3 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
EHD3Q9NZN3 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
EHD3Q9NZN3 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
EHD3Q9NZN3 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC17.24■□□□□ 0.35
EHD3Q9NZN3 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
EHD3Q9NZN3 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
EHD3Q9NZN3 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
EHD3Q9NZN3 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
EHD3Q9NZN3 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
EHD3Q9NZN3 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
EHD3Q9NZN3 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
EHD3Q9NZN3 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
EHD3Q9NZN3 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
EHD3Q9NZN3 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
EHD3Q9NZN3 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
EHD3Q9NZN3 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
EHD3Q9NZN3 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
EHD3Q9NZN3 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
EHD3Q9NZN3 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms