Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZM4

BICRA, BRD4-interacting chromatin-remodeling complex-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,560 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BICRAQ9NZM4 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC33.24■■■□□ 2.91
BICRAQ9NZM4 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC33.24■■■□□ 2.91
BICRAQ9NZM4 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC33.24■■■□□ 2.91
BICRAQ9NZM4 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
BICRAQ9NZM4 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
BICRAQ9NZM4 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
BICRAQ9NZM4 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC33.23■■■□□ 2.91
BICRAQ9NZM4 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC33.23■■■□□ 2.91
BICRAQ9NZM4 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.23■■■□□ 2.91
BICRAQ9NZM4 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
BICRAQ9NZM4 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
BICRAQ9NZM4 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
BICRAQ9NZM4 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC33.23■■■□□ 2.91
BICRAQ9NZM4 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC33.23■■■□□ 2.91
BICRAQ9NZM4 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC33.23■■■□□ 2.91
BICRAQ9NZM4 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
BICRAQ9NZM4 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
BICRAQ9NZM4 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
BICRAQ9NZM4 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC33.22■■■□□ 2.91
BICRAQ9NZM4 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
BICRAQ9NZM4 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
BICRAQ9NZM4 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC33.22■■■□□ 2.91
BICRAQ9NZM4 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.22■■■□□ 2.91
BICRAQ9NZM4 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC33.22■■■□□ 2.91
BICRAQ9NZM4 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.22■■■□□ 2.91
BICRAQ9NZM4 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC33.22■■■□□ 2.91
BICRAQ9NZM4 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
BICRAQ9NZM4 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
BICRAQ9NZM4 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
BICRAQ9NZM4 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC33.21■■■□□ 2.91
BICRAQ9NZM4 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.21■■■□□ 2.91
BICRAQ9NZM4 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC33.21■■■□□ 2.91
BICRAQ9NZM4 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC33.21■■■□□ 2.91
BICRAQ9NZM4 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC33.21■■■□□ 2.91
BICRAQ9NZM4 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.21■■■□□ 2.91
BICRAQ9NZM4 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.21■■■□□ 2.91
BICRAQ9NZM4 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
BICRAQ9NZM4 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
BICRAQ9NZM4 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
BICRAQ9NZM4 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
BICRAQ9NZM4 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
BICRAQ9NZM4 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC33.21■■■□□ 2.91
BICRAQ9NZM4 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC33.21■■■□□ 2.91
BICRAQ9NZM4 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
BICRAQ9NZM4 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC33.21■■■□□ 2.91
BICRAQ9NZM4 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC33.21■■■□□ 2.91
BICRAQ9NZM4 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC33.21■■■□□ 2.91
BICRAQ9NZM4 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC33.21■■■□□ 2.91
BICRAQ9NZM4 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
BICRAQ9NZM4 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
BICRAQ9NZM4 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
BICRAQ9NZM4 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC33.2■■■□□ 2.91
BICRAQ9NZM4 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC33.2■■■□□ 2.91
BICRAQ9NZM4 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.2■■■□□ 2.91
BICRAQ9NZM4 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC33.2■■■□□ 2.91
BICRAQ9NZM4 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.2■■■□□ 2.91
BICRAQ9NZM4 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
BICRAQ9NZM4 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.2■■■□□ 2.91
BICRAQ9NZM4 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
BICRAQ9NZM4 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC33.2■■■□□ 2.91
BICRAQ9NZM4 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC33.2■■■□□ 2.91
BICRAQ9NZM4 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC33.2■■■□□ 2.91
BICRAQ9NZM4 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.2■■■□□ 2.9
BICRAQ9NZM4 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.9
BICRAQ9NZM4 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.9
BICRAQ9NZM4 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.19■■■□□ 2.9
BICRAQ9NZM4 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
BICRAQ9NZM4 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
BICRAQ9NZM4 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
BICRAQ9NZM4 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC33.19■■■□□ 2.9
BICRAQ9NZM4 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC33.19■■■□□ 2.9
BICRAQ9NZM4 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
BICRAQ9NZM4 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.19■■■□□ 2.9
BICRAQ9NZM4 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
BICRAQ9NZM4 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
BICRAQ9NZM4 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC33.19■■■□□ 2.9
BICRAQ9NZM4 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
BICRAQ9NZM4 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.19■■■□□ 2.9
BICRAQ9NZM4 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
BICRAQ9NZM4 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.19■■■□□ 2.9
BICRAQ9NZM4 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.18■■■□□ 2.9
BICRAQ9NZM4 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC33.18■■■□□ 2.9
BICRAQ9NZM4 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC33.18■■■□□ 2.9
BICRAQ9NZM4 STMN4-207ENST00000523048 1224 ntTSL 2 BASIC33.18■■■□□ 2.9
BICRAQ9NZM4 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC33.18■■■□□ 2.9
BICRAQ9NZM4 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
BICRAQ9NZM4 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
BICRAQ9NZM4 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC33.18■■■□□ 2.9
BICRAQ9NZM4 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.18■■■□□ 2.9
BICRAQ9NZM4 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC33.18■■■□□ 2.9
BICRAQ9NZM4 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC33.18■■■□□ 2.9
BICRAQ9NZM4 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC33.17■■■□□ 2.9
BICRAQ9NZM4 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
BICRAQ9NZM4 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
BICRAQ9NZM4 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC33.17■■■□□ 2.9
BICRAQ9NZM4 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC33.17■■■□□ 2.9
BICRAQ9NZM4 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC33.17■■■□□ 2.9
BICRAQ9NZM4 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.17■■■□□ 2.9
BICRAQ9NZM4 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC33.17■■■□□ 2.9
BICRAQ9NZM4 AL606495.2-201ENST00000605867 535 ntBASIC33.17■■■□□ 2.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms