Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZI2

KCNIP1, Kv channel-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNIP1Q9NZI2 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
KCNIP1Q9NZI2 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KCNIP1Q9NZI2 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KCNIP1Q9NZI2 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
KCNIP1Q9NZI2 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KCNIP1Q9NZI2 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KCNIP1Q9NZI2 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KCNIP1Q9NZI2 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KCNIP1Q9NZI2 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KCNIP1Q9NZI2 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KCNIP1Q9NZI2 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KCNIP1Q9NZI2 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KCNIP1Q9NZI2 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KCNIP1Q9NZI2 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KCNIP1Q9NZI2 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KCNIP1Q9NZI2 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KCNIP1Q9NZI2 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KCNIP1Q9NZI2 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KCNIP1Q9NZI2 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KCNIP1Q9NZI2 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KCNIP1Q9NZI2 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KCNIP1Q9NZI2 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KCNIP1Q9NZI2 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KCNIP1Q9NZI2 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KCNIP1Q9NZI2 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KCNIP1Q9NZI2 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KCNIP1Q9NZI2 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KCNIP1Q9NZI2 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KCNIP1Q9NZI2 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KCNIP1Q9NZI2 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KCNIP1Q9NZI2 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KCNIP1Q9NZI2 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KCNIP1Q9NZI2 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KCNIP1Q9NZI2 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KCNIP1Q9NZI2 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KCNIP1Q9NZI2 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KCNIP1Q9NZI2 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KCNIP1Q9NZI2 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KCNIP1Q9NZI2 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KCNIP1Q9NZI2 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KCNIP1Q9NZI2 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KCNIP1Q9NZI2 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KCNIP1Q9NZI2 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KCNIP1Q9NZI2 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KCNIP1Q9NZI2 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KCNIP1Q9NZI2 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KCNIP1Q9NZI2 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
KCNIP1Q9NZI2 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KCNIP1Q9NZI2 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
KCNIP1Q9NZI2 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KCNIP1Q9NZI2 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KCNIP1Q9NZI2 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KCNIP1Q9NZI2 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KCNIP1Q9NZI2 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KCNIP1Q9NZI2 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KCNIP1Q9NZI2 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
KCNIP1Q9NZI2 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KCNIP1Q9NZI2 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KCNIP1Q9NZI2 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KCNIP1Q9NZI2 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KCNIP1Q9NZI2 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KCNIP1Q9NZI2 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KCNIP1Q9NZI2 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KCNIP1Q9NZI2 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KCNIP1Q9NZI2 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KCNIP1Q9NZI2 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KCNIP1Q9NZI2 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KCNIP1Q9NZI2 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KCNIP1Q9NZI2 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KCNIP1Q9NZI2 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KCNIP1Q9NZI2 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KCNIP1Q9NZI2 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KCNIP1Q9NZI2 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KCNIP1Q9NZI2 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KCNIP1Q9NZI2 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KCNIP1Q9NZI2 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KCNIP1Q9NZI2 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KCNIP1Q9NZI2 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KCNIP1Q9NZI2 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KCNIP1Q9NZI2 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KCNIP1Q9NZI2 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KCNIP1Q9NZI2 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KCNIP1Q9NZI2 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KCNIP1Q9NZI2 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KCNIP1Q9NZI2 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KCNIP1Q9NZI2 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KCNIP1Q9NZI2 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KCNIP1Q9NZI2 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KCNIP1Q9NZI2 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KCNIP1Q9NZI2 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KCNIP1Q9NZI2 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KCNIP1Q9NZI2 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KCNIP1Q9NZI2 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KCNIP1Q9NZI2 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
KCNIP1Q9NZI2 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KCNIP1Q9NZI2 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KCNIP1Q9NZI2 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
KCNIP1Q9NZI2 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KCNIP1Q9NZI2 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KCNIP1Q9NZI2 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms