Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUN5

LMBRD1, Probable lysosomal cobalamin transporter, humanhuman

Predictions only

Length 540 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMBRD1Q9NUN5 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
LMBRD1Q9NUN5 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
LMBRD1Q9NUN5 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
LMBRD1Q9NUN5 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
LMBRD1Q9NUN5 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
LMBRD1Q9NUN5 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
LMBRD1Q9NUN5 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
LMBRD1Q9NUN5 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
LMBRD1Q9NUN5 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
LMBRD1Q9NUN5 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
LMBRD1Q9NUN5 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
LMBRD1Q9NUN5 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
LMBRD1Q9NUN5 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
LMBRD1Q9NUN5 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
LMBRD1Q9NUN5 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
LMBRD1Q9NUN5 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
LMBRD1Q9NUN5 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
LMBRD1Q9NUN5 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
LMBRD1Q9NUN5 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
LMBRD1Q9NUN5 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
LMBRD1Q9NUN5 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
LMBRD1Q9NUN5 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
LMBRD1Q9NUN5 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
LMBRD1Q9NUN5 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
LMBRD1Q9NUN5 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
LMBRD1Q9NUN5 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
LMBRD1Q9NUN5 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
LMBRD1Q9NUN5 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
LMBRD1Q9NUN5 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
LMBRD1Q9NUN5 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
LMBRD1Q9NUN5 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
LMBRD1Q9NUN5 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
LMBRD1Q9NUN5 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
LMBRD1Q9NUN5 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
LMBRD1Q9NUN5 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
LMBRD1Q9NUN5 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
LMBRD1Q9NUN5 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
LMBRD1Q9NUN5 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC20.72■□□□□ 0.91
LMBRD1Q9NUN5 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
LMBRD1Q9NUN5 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
LMBRD1Q9NUN5 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
LMBRD1Q9NUN5 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
LMBRD1Q9NUN5 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
LMBRD1Q9NUN5 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
LMBRD1Q9NUN5 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
LMBRD1Q9NUN5 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
LMBRD1Q9NUN5 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
LMBRD1Q9NUN5 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
LMBRD1Q9NUN5 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
LMBRD1Q9NUN5 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
LMBRD1Q9NUN5 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
LMBRD1Q9NUN5 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
LMBRD1Q9NUN5 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
LMBRD1Q9NUN5 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
LMBRD1Q9NUN5 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
LMBRD1Q9NUN5 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
LMBRD1Q9NUN5 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
LMBRD1Q9NUN5 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
LMBRD1Q9NUN5 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
LMBRD1Q9NUN5 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
LMBRD1Q9NUN5 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
LMBRD1Q9NUN5 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
LMBRD1Q9NUN5 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
LMBRD1Q9NUN5 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
LMBRD1Q9NUN5 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
LMBRD1Q9NUN5 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC20.71■□□□□ 0.91
LMBRD1Q9NUN5 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
LMBRD1Q9NUN5 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
LMBRD1Q9NUN5 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
LMBRD1Q9NUN5 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
LMBRD1Q9NUN5 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
LMBRD1Q9NUN5 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC20.7■□□□□ 0.91
LMBRD1Q9NUN5 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
LMBRD1Q9NUN5 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
LMBRD1Q9NUN5 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
LMBRD1Q9NUN5 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
LMBRD1Q9NUN5 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
LMBRD1Q9NUN5 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
LMBRD1Q9NUN5 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
LMBRD1Q9NUN5 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
LMBRD1Q9NUN5 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
LMBRD1Q9NUN5 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
LMBRD1Q9NUN5 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
LMBRD1Q9NUN5 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
LMBRD1Q9NUN5 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
LMBRD1Q9NUN5 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
LMBRD1Q9NUN5 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
LMBRD1Q9NUN5 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
LMBRD1Q9NUN5 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
LMBRD1Q9NUN5 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
LMBRD1Q9NUN5 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
LMBRD1Q9NUN5 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
LMBRD1Q9NUN5 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
LMBRD1Q9NUN5 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
LMBRD1Q9NUN5 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
LMBRD1Q9NUN5 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
LMBRD1Q9NUN5 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
LMBRD1Q9NUN5 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
LMBRD1Q9NUN5 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
LMBRD1Q9NUN5 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms