Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUM3

SLC39A9, Zinc transporter ZIP9, humanhuman

Predictions only

Length 307 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC39A9Q9NUM3 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SLC39A9Q9NUM3 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SLC39A9Q9NUM3 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SLC39A9Q9NUM3 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
SLC39A9Q9NUM3 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SLC39A9Q9NUM3 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SLC39A9Q9NUM3 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SLC39A9Q9NUM3 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SLC39A9Q9NUM3 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SLC39A9Q9NUM3 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SLC39A9Q9NUM3 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SLC39A9Q9NUM3 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SLC39A9Q9NUM3 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SLC39A9Q9NUM3 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SLC39A9Q9NUM3 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SLC39A9Q9NUM3 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SLC39A9Q9NUM3 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SLC39A9Q9NUM3 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SLC39A9Q9NUM3 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SLC39A9Q9NUM3 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
SLC39A9Q9NUM3 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
SLC39A9Q9NUM3 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SLC39A9Q9NUM3 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SLC39A9Q9NUM3 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SLC39A9Q9NUM3 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SLC39A9Q9NUM3 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
SLC39A9Q9NUM3 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SLC39A9Q9NUM3 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SLC39A9Q9NUM3 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SLC39A9Q9NUM3 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SLC39A9Q9NUM3 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SLC39A9Q9NUM3 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SLC39A9Q9NUM3 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SLC39A9Q9NUM3 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SLC39A9Q9NUM3 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SLC39A9Q9NUM3 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SLC39A9Q9NUM3 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SLC39A9Q9NUM3 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SLC39A9Q9NUM3 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
SLC39A9Q9NUM3 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SLC39A9Q9NUM3 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SLC39A9Q9NUM3 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SLC39A9Q9NUM3 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SLC39A9Q9NUM3 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SLC39A9Q9NUM3 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SLC39A9Q9NUM3 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SLC39A9Q9NUM3 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SLC39A9Q9NUM3 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SLC39A9Q9NUM3 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SLC39A9Q9NUM3 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SLC39A9Q9NUM3 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SLC39A9Q9NUM3 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SLC39A9Q9NUM3 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SLC39A9Q9NUM3 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SLC39A9Q9NUM3 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SLC39A9Q9NUM3 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SLC39A9Q9NUM3 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SLC39A9Q9NUM3 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SLC39A9Q9NUM3 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SLC39A9Q9NUM3 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SLC39A9Q9NUM3 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SLC39A9Q9NUM3 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SLC39A9Q9NUM3 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SLC39A9Q9NUM3 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SLC39A9Q9NUM3 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SLC39A9Q9NUM3 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SLC39A9Q9NUM3 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SLC39A9Q9NUM3 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SLC39A9Q9NUM3 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SLC39A9Q9NUM3 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SLC39A9Q9NUM3 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SLC39A9Q9NUM3 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SLC39A9Q9NUM3 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
SLC39A9Q9NUM3 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SLC39A9Q9NUM3 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SLC39A9Q9NUM3 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SLC39A9Q9NUM3 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SLC39A9Q9NUM3 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SLC39A9Q9NUM3 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SLC39A9Q9NUM3 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SLC39A9Q9NUM3 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SLC39A9Q9NUM3 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SLC39A9Q9NUM3 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SLC39A9Q9NUM3 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
SLC39A9Q9NUM3 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SLC39A9Q9NUM3 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SLC39A9Q9NUM3 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SLC39A9Q9NUM3 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SLC39A9Q9NUM3 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SLC39A9Q9NUM3 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SLC39A9Q9NUM3 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SLC39A9Q9NUM3 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SLC39A9Q9NUM3 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SLC39A9Q9NUM3 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SLC39A9Q9NUM3 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SLC39A9Q9NUM3 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SLC39A9Q9NUM3 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SLC39A9Q9NUM3 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SLC39A9Q9NUM3 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SLC39A9Q9NUM3 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms