Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTG1

PKDREJ, Polycystic kidney disease and receptor for egg jelly-related protein, humanhuman

Predictions only

Length 2,253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKDREJQ9NTG1 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PKDREJQ9NTG1 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PKDREJQ9NTG1 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PKDREJQ9NTG1 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PKDREJQ9NTG1 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PKDREJQ9NTG1 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PKDREJQ9NTG1 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PKDREJQ9NTG1 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PKDREJQ9NTG1 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PKDREJQ9NTG1 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PKDREJQ9NTG1 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PKDREJQ9NTG1 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PKDREJQ9NTG1 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PKDREJQ9NTG1 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PKDREJQ9NTG1 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PKDREJQ9NTG1 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PKDREJQ9NTG1 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PKDREJQ9NTG1 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PKDREJQ9NTG1 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PKDREJQ9NTG1 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PKDREJQ9NTG1 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
PKDREJQ9NTG1 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PKDREJQ9NTG1 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PKDREJQ9NTG1 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PKDREJQ9NTG1 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PKDREJQ9NTG1 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
PKDREJQ9NTG1 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PKDREJQ9NTG1 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PKDREJQ9NTG1 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
PKDREJQ9NTG1 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PKDREJQ9NTG1 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PKDREJQ9NTG1 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PKDREJQ9NTG1 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PKDREJQ9NTG1 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PKDREJQ9NTG1 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PKDREJQ9NTG1 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PKDREJQ9NTG1 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PKDREJQ9NTG1 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PKDREJQ9NTG1 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PKDREJQ9NTG1 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PKDREJQ9NTG1 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PKDREJQ9NTG1 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PKDREJQ9NTG1 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PKDREJQ9NTG1 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PKDREJQ9NTG1 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PKDREJQ9NTG1 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PKDREJQ9NTG1 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PKDREJQ9NTG1 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PKDREJQ9NTG1 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PKDREJQ9NTG1 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PKDREJQ9NTG1 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PKDREJQ9NTG1 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
PKDREJQ9NTG1 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PKDREJQ9NTG1 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PKDREJQ9NTG1 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PKDREJQ9NTG1 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PKDREJQ9NTG1 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
PKDREJQ9NTG1 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PKDREJQ9NTG1 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
PKDREJQ9NTG1 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PKDREJQ9NTG1 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PKDREJQ9NTG1 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PKDREJQ9NTG1 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PKDREJQ9NTG1 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PKDREJQ9NTG1 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PKDREJQ9NTG1 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PKDREJQ9NTG1 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PKDREJQ9NTG1 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PKDREJQ9NTG1 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PKDREJQ9NTG1 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PKDREJQ9NTG1 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PKDREJQ9NTG1 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
PKDREJQ9NTG1 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
PKDREJQ9NTG1 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
PKDREJQ9NTG1 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
PKDREJQ9NTG1 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
PKDREJQ9NTG1 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PKDREJQ9NTG1 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PKDREJQ9NTG1 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PKDREJQ9NTG1 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PKDREJQ9NTG1 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PKDREJQ9NTG1 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PKDREJQ9NTG1 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PKDREJQ9NTG1 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PKDREJQ9NTG1 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PKDREJQ9NTG1 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PKDREJQ9NTG1 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
PKDREJQ9NTG1 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PKDREJQ9NTG1 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PKDREJQ9NTG1 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PKDREJQ9NTG1 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PKDREJQ9NTG1 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PKDREJQ9NTG1 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PKDREJQ9NTG1 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PKDREJQ9NTG1 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PKDREJQ9NTG1 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PKDREJQ9NTG1 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PKDREJQ9NTG1 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PKDREJQ9NTG1 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PKDREJQ9NTG1 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms