Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPY3

CD93, Complement component C1q receptor, humanhuman

Predictions only

Length 652 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD93Q9NPY3 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CD93Q9NPY3 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CD93Q9NPY3 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CD93Q9NPY3 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CD93Q9NPY3 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CD93Q9NPY3 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CD93Q9NPY3 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CD93Q9NPY3 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CD93Q9NPY3 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CD93Q9NPY3 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CD93Q9NPY3 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CD93Q9NPY3 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CD93Q9NPY3 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CD93Q9NPY3 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CD93Q9NPY3 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CD93Q9NPY3 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CD93Q9NPY3 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CD93Q9NPY3 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CD93Q9NPY3 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CD93Q9NPY3 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CD93Q9NPY3 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CD93Q9NPY3 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CD93Q9NPY3 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CD93Q9NPY3 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CD93Q9NPY3 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CD93Q9NPY3 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CD93Q9NPY3 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CD93Q9NPY3 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CD93Q9NPY3 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CD93Q9NPY3 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CD93Q9NPY3 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CD93Q9NPY3 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CD93Q9NPY3 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CD93Q9NPY3 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CD93Q9NPY3 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
CD93Q9NPY3 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CD93Q9NPY3 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CD93Q9NPY3 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CD93Q9NPY3 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CD93Q9NPY3 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CD93Q9NPY3 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CD93Q9NPY3 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CD93Q9NPY3 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CD93Q9NPY3 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CD93Q9NPY3 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CD93Q9NPY3 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CD93Q9NPY3 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CD93Q9NPY3 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CD93Q9NPY3 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CD93Q9NPY3 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CD93Q9NPY3 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CD93Q9NPY3 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CD93Q9NPY3 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CD93Q9NPY3 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CD93Q9NPY3 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CD93Q9NPY3 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CD93Q9NPY3 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CD93Q9NPY3 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CD93Q9NPY3 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CD93Q9NPY3 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CD93Q9NPY3 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CD93Q9NPY3 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CD93Q9NPY3 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CD93Q9NPY3 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CD93Q9NPY3 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CD93Q9NPY3 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CD93Q9NPY3 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CD93Q9NPY3 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CD93Q9NPY3 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CD93Q9NPY3 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CD93Q9NPY3 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CD93Q9NPY3 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CD93Q9NPY3 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CD93Q9NPY3 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CD93Q9NPY3 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CD93Q9NPY3 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CD93Q9NPY3 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CD93Q9NPY3 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CD93Q9NPY3 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CD93Q9NPY3 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CD93Q9NPY3 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CD93Q9NPY3 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CD93Q9NPY3 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CD93Q9NPY3 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CD93Q9NPY3 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CD93Q9NPY3 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CD93Q9NPY3 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CD93Q9NPY3 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CD93Q9NPY3 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CD93Q9NPY3 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CD93Q9NPY3 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CD93Q9NPY3 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CD93Q9NPY3 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CD93Q9NPY3 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CD93Q9NPY3 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CD93Q9NPY3 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CD93Q9NPY3 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CD93Q9NPY3 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CD93Q9NPY3 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CD93Q9NPY3 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms