Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPR2

SEMA4B, Semaphorin-4B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 832 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4BQ9NPR2 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SEMA4BQ9NPR2 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SEMA4BQ9NPR2 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SEMA4BQ9NPR2 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SEMA4BQ9NPR2 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SEMA4BQ9NPR2 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SEMA4BQ9NPR2 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
SEMA4BQ9NPR2 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SEMA4BQ9NPR2 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SEMA4BQ9NPR2 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SEMA4BQ9NPR2 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SEMA4BQ9NPR2 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SEMA4BQ9NPR2 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SEMA4BQ9NPR2 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SEMA4BQ9NPR2 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
SEMA4BQ9NPR2 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
SEMA4BQ9NPR2 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SEMA4BQ9NPR2 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SEMA4BQ9NPR2 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SEMA4BQ9NPR2 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SEMA4BQ9NPR2 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SEMA4BQ9NPR2 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SEMA4BQ9NPR2 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SEMA4BQ9NPR2 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SEMA4BQ9NPR2 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SEMA4BQ9NPR2 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SEMA4BQ9NPR2 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SEMA4BQ9NPR2 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SEMA4BQ9NPR2 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SEMA4BQ9NPR2 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SEMA4BQ9NPR2 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SEMA4BQ9NPR2 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SEMA4BQ9NPR2 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SEMA4BQ9NPR2 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SEMA4BQ9NPR2 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SEMA4BQ9NPR2 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SEMA4BQ9NPR2 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SEMA4BQ9NPR2 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SEMA4BQ9NPR2 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
SEMA4BQ9NPR2 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SEMA4BQ9NPR2 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
SEMA4BQ9NPR2 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SEMA4BQ9NPR2 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
SEMA4BQ9NPR2 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SEMA4BQ9NPR2 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SEMA4BQ9NPR2 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SEMA4BQ9NPR2 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SEMA4BQ9NPR2 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SEMA4BQ9NPR2 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SEMA4BQ9NPR2 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SEMA4BQ9NPR2 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SEMA4BQ9NPR2 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SEMA4BQ9NPR2 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SEMA4BQ9NPR2 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SEMA4BQ9NPR2 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SEMA4BQ9NPR2 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SEMA4BQ9NPR2 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SEMA4BQ9NPR2 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SEMA4BQ9NPR2 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SEMA4BQ9NPR2 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SEMA4BQ9NPR2 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SEMA4BQ9NPR2 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SEMA4BQ9NPR2 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SEMA4BQ9NPR2 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SEMA4BQ9NPR2 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SEMA4BQ9NPR2 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SEMA4BQ9NPR2 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SEMA4BQ9NPR2 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SEMA4BQ9NPR2 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SEMA4BQ9NPR2 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SEMA4BQ9NPR2 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SEMA4BQ9NPR2 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SEMA4BQ9NPR2 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SEMA4BQ9NPR2 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SEMA4BQ9NPR2 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SEMA4BQ9NPR2 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SEMA4BQ9NPR2 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SEMA4BQ9NPR2 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SEMA4BQ9NPR2 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SEMA4BQ9NPR2 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SEMA4BQ9NPR2 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SEMA4BQ9NPR2 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SEMA4BQ9NPR2 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SEMA4BQ9NPR2 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SEMA4BQ9NPR2 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SEMA4BQ9NPR2 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SEMA4BQ9NPR2 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SEMA4BQ9NPR2 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SEMA4BQ9NPR2 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SEMA4BQ9NPR2 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SEMA4BQ9NPR2 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SEMA4BQ9NPR2 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SEMA4BQ9NPR2 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SEMA4BQ9NPR2 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SEMA4BQ9NPR2 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SEMA4BQ9NPR2 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SEMA4BQ9NPR2 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SEMA4BQ9NPR2 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SEMA4BQ9NPR2 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SEMA4BQ9NPR2 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms