Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP62

GCM1, Chorion-specific transcription factor GCMa, humanhuman

Predictions only

Length 436 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCM1Q9NP62 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GCM1Q9NP62 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GCM1Q9NP62 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GCM1Q9NP62 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GCM1Q9NP62 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
GCM1Q9NP62 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GCM1Q9NP62 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GCM1Q9NP62 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GCM1Q9NP62 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GCM1Q9NP62 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GCM1Q9NP62 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GCM1Q9NP62 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
GCM1Q9NP62 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GCM1Q9NP62 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GCM1Q9NP62 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
GCM1Q9NP62 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
GCM1Q9NP62 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GCM1Q9NP62 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GCM1Q9NP62 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GCM1Q9NP62 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GCM1Q9NP62 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GCM1Q9NP62 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GCM1Q9NP62 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
GCM1Q9NP62 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GCM1Q9NP62 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GCM1Q9NP62 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GCM1Q9NP62 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GCM1Q9NP62 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GCM1Q9NP62 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GCM1Q9NP62 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GCM1Q9NP62 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GCM1Q9NP62 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GCM1Q9NP62 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GCM1Q9NP62 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GCM1Q9NP62 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GCM1Q9NP62 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GCM1Q9NP62 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GCM1Q9NP62 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GCM1Q9NP62 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GCM1Q9NP62 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
GCM1Q9NP62 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GCM1Q9NP62 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GCM1Q9NP62 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GCM1Q9NP62 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GCM1Q9NP62 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GCM1Q9NP62 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
GCM1Q9NP62 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GCM1Q9NP62 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
GCM1Q9NP62 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GCM1Q9NP62 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GCM1Q9NP62 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GCM1Q9NP62 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GCM1Q9NP62 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GCM1Q9NP62 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GCM1Q9NP62 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GCM1Q9NP62 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GCM1Q9NP62 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GCM1Q9NP62 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GCM1Q9NP62 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GCM1Q9NP62 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GCM1Q9NP62 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GCM1Q9NP62 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GCM1Q9NP62 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GCM1Q9NP62 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GCM1Q9NP62 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GCM1Q9NP62 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GCM1Q9NP62 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
GCM1Q9NP62 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GCM1Q9NP62 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GCM1Q9NP62 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GCM1Q9NP62 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GCM1Q9NP62 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GCM1Q9NP62 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
GCM1Q9NP62 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GCM1Q9NP62 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GCM1Q9NP62 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GCM1Q9NP62 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GCM1Q9NP62 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GCM1Q9NP62 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GCM1Q9NP62 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GCM1Q9NP62 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GCM1Q9NP62 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GCM1Q9NP62 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GCM1Q9NP62 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GCM1Q9NP62 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GCM1Q9NP62 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GCM1Q9NP62 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GCM1Q9NP62 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GCM1Q9NP62 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GCM1Q9NP62 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
GCM1Q9NP62 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
GCM1Q9NP62 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GCM1Q9NP62 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
GCM1Q9NP62 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
GCM1Q9NP62 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GCM1Q9NP62 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GCM1Q9NP62 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GCM1Q9NP62 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GCM1Q9NP62 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GCM1Q9NP62 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms