Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBJ7

USP29, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 29, humanhuman

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Length 922 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP29Q9HBJ7 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
USP29Q9HBJ7 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
USP29Q9HBJ7 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
USP29Q9HBJ7 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
USP29Q9HBJ7 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
USP29Q9HBJ7 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
USP29Q9HBJ7 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
USP29Q9HBJ7 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
USP29Q9HBJ7 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
USP29Q9HBJ7 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
USP29Q9HBJ7 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
USP29Q9HBJ7 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
USP29Q9HBJ7 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
USP29Q9HBJ7 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
USP29Q9HBJ7 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
USP29Q9HBJ7 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
USP29Q9HBJ7 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
USP29Q9HBJ7 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
USP29Q9HBJ7 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
USP29Q9HBJ7 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
USP29Q9HBJ7 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
USP29Q9HBJ7 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
USP29Q9HBJ7 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
USP29Q9HBJ7 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
USP29Q9HBJ7 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
USP29Q9HBJ7 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
USP29Q9HBJ7 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
USP29Q9HBJ7 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
USP29Q9HBJ7 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
USP29Q9HBJ7 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
USP29Q9HBJ7 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
USP29Q9HBJ7 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
USP29Q9HBJ7 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
USP29Q9HBJ7 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
USP29Q9HBJ7 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
USP29Q9HBJ7 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
USP29Q9HBJ7 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
USP29Q9HBJ7 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
USP29Q9HBJ7 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
USP29Q9HBJ7 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
USP29Q9HBJ7 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
USP29Q9HBJ7 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
USP29Q9HBJ7 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
USP29Q9HBJ7 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
USP29Q9HBJ7 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
USP29Q9HBJ7 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
USP29Q9HBJ7 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
USP29Q9HBJ7 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
USP29Q9HBJ7 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
USP29Q9HBJ7 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
USP29Q9HBJ7 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
USP29Q9HBJ7 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
USP29Q9HBJ7 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
USP29Q9HBJ7 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
USP29Q9HBJ7 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
USP29Q9HBJ7 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
USP29Q9HBJ7 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
USP29Q9HBJ7 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
USP29Q9HBJ7 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
USP29Q9HBJ7 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
USP29Q9HBJ7 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
USP29Q9HBJ7 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
USP29Q9HBJ7 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
USP29Q9HBJ7 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
USP29Q9HBJ7 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
USP29Q9HBJ7 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
USP29Q9HBJ7 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
USP29Q9HBJ7 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
USP29Q9HBJ7 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.6■□□□□ 0.57
USP29Q9HBJ7 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
USP29Q9HBJ7 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
USP29Q9HBJ7 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
USP29Q9HBJ7 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
USP29Q9HBJ7 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
USP29Q9HBJ7 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
USP29Q9HBJ7 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
USP29Q9HBJ7 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
USP29Q9HBJ7 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
USP29Q9HBJ7 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
USP29Q9HBJ7 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
USP29Q9HBJ7 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
USP29Q9HBJ7 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
USP29Q9HBJ7 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
USP29Q9HBJ7 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
USP29Q9HBJ7 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
USP29Q9HBJ7 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
USP29Q9HBJ7 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
USP29Q9HBJ7 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
USP29Q9HBJ7 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
USP29Q9HBJ7 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
USP29Q9HBJ7 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
USP29Q9HBJ7 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
USP29Q9HBJ7 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
USP29Q9HBJ7 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
USP29Q9HBJ7 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
USP29Q9HBJ7 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
USP29Q9HBJ7 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
USP29Q9HBJ7 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
USP29Q9HBJ7 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
USP29Q9HBJ7 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
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