Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAW4

CLSPN, Claspin, humanhuman

Predictions only

Length 1,339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSPNQ9HAW4 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CLSPNQ9HAW4 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CLSPNQ9HAW4 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CLSPNQ9HAW4 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CLSPNQ9HAW4 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CLSPNQ9HAW4 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CLSPNQ9HAW4 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CLSPNQ9HAW4 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CLSPNQ9HAW4 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CLSPNQ9HAW4 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CLSPNQ9HAW4 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CLSPNQ9HAW4 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CLSPNQ9HAW4 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CLSPNQ9HAW4 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CLSPNQ9HAW4 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CLSPNQ9HAW4 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CLSPNQ9HAW4 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CLSPNQ9HAW4 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CLSPNQ9HAW4 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CLSPNQ9HAW4 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CLSPNQ9HAW4 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CLSPNQ9HAW4 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CLSPNQ9HAW4 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CLSPNQ9HAW4 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CLSPNQ9HAW4 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CLSPNQ9HAW4 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CLSPNQ9HAW4 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CLSPNQ9HAW4 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CLSPNQ9HAW4 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CLSPNQ9HAW4 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CLSPNQ9HAW4 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CLSPNQ9HAW4 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
CLSPNQ9HAW4 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CLSPNQ9HAW4 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
CLSPNQ9HAW4 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CLSPNQ9HAW4 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CLSPNQ9HAW4 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CLSPNQ9HAW4 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
CLSPNQ9HAW4 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CLSPNQ9HAW4 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CLSPNQ9HAW4 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CLSPNQ9HAW4 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CLSPNQ9HAW4 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
CLSPNQ9HAW4 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CLSPNQ9HAW4 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CLSPNQ9HAW4 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CLSPNQ9HAW4 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
CLSPNQ9HAW4 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
CLSPNQ9HAW4 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CLSPNQ9HAW4 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CLSPNQ9HAW4 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
CLSPNQ9HAW4 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CLSPNQ9HAW4 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CLSPNQ9HAW4 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CLSPNQ9HAW4 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CLSPNQ9HAW4 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CLSPNQ9HAW4 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CLSPNQ9HAW4 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CLSPNQ9HAW4 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CLSPNQ9HAW4 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CLSPNQ9HAW4 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
CLSPNQ9HAW4 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CLSPNQ9HAW4 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CLSPNQ9HAW4 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
CLSPNQ9HAW4 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CLSPNQ9HAW4 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CLSPNQ9HAW4 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CLSPNQ9HAW4 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CLSPNQ9HAW4 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CLSPNQ9HAW4 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CLSPNQ9HAW4 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CLSPNQ9HAW4 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CLSPNQ9HAW4 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CLSPNQ9HAW4 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CLSPNQ9HAW4 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CLSPNQ9HAW4 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CLSPNQ9HAW4 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CLSPNQ9HAW4 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CLSPNQ9HAW4 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CLSPNQ9HAW4 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CLSPNQ9HAW4 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CLSPNQ9HAW4 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CLSPNQ9HAW4 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CLSPNQ9HAW4 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CLSPNQ9HAW4 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CLSPNQ9HAW4 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CLSPNQ9HAW4 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CLSPNQ9HAW4 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
CLSPNQ9HAW4 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CLSPNQ9HAW4 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CLSPNQ9HAW4 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CLSPNQ9HAW4 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CLSPNQ9HAW4 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CLSPNQ9HAW4 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CLSPNQ9HAW4 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CLSPNQ9HAW4 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CLSPNQ9HAW4 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CLSPNQ9HAW4 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CLSPNQ9HAW4 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CLSPNQ9HAW4 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms