Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZZ6

CHRNA10, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-10, humanhuman

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA10Q9GZZ6 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CHRNA10Q9GZZ6 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CHRNA10Q9GZZ6 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CHRNA10Q9GZZ6 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CHRNA10Q9GZZ6 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CHRNA10Q9GZZ6 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CHRNA10Q9GZZ6 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CHRNA10Q9GZZ6 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CHRNA10Q9GZZ6 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CHRNA10Q9GZZ6 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CHRNA10Q9GZZ6 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CHRNA10Q9GZZ6 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CHRNA10Q9GZZ6 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CHRNA10Q9GZZ6 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CHRNA10Q9GZZ6 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CHRNA10Q9GZZ6 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CHRNA10Q9GZZ6 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CHRNA10Q9GZZ6 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CHRNA10Q9GZZ6 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CHRNA10Q9GZZ6 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CHRNA10Q9GZZ6 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CHRNA10Q9GZZ6 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CHRNA10Q9GZZ6 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CHRNA10Q9GZZ6 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CHRNA10Q9GZZ6 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CHRNA10Q9GZZ6 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CHRNA10Q9GZZ6 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CHRNA10Q9GZZ6 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CHRNA10Q9GZZ6 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CHRNA10Q9GZZ6 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CHRNA10Q9GZZ6 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CHRNA10Q9GZZ6 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CHRNA10Q9GZZ6 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CHRNA10Q9GZZ6 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CHRNA10Q9GZZ6 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CHRNA10Q9GZZ6 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CHRNA10Q9GZZ6 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CHRNA10Q9GZZ6 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CHRNA10Q9GZZ6 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CHRNA10Q9GZZ6 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CHRNA10Q9GZZ6 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CHRNA10Q9GZZ6 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CHRNA10Q9GZZ6 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CHRNA10Q9GZZ6 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CHRNA10Q9GZZ6 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CHRNA10Q9GZZ6 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CHRNA10Q9GZZ6 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CHRNA10Q9GZZ6 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CHRNA10Q9GZZ6 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CHRNA10Q9GZZ6 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CHRNA10Q9GZZ6 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CHRNA10Q9GZZ6 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CHRNA10Q9GZZ6 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CHRNA10Q9GZZ6 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CHRNA10Q9GZZ6 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CHRNA10Q9GZZ6 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CHRNA10Q9GZZ6 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CHRNA10Q9GZZ6 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CHRNA10Q9GZZ6 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CHRNA10Q9GZZ6 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CHRNA10Q9GZZ6 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CHRNA10Q9GZZ6 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CHRNA10Q9GZZ6 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CHRNA10Q9GZZ6 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CHRNA10Q9GZZ6 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CHRNA10Q9GZZ6 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CHRNA10Q9GZZ6 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CHRNA10Q9GZZ6 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CHRNA10Q9GZZ6 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CHRNA10Q9GZZ6 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CHRNA10Q9GZZ6 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CHRNA10Q9GZZ6 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CHRNA10Q9GZZ6 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CHRNA10Q9GZZ6 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CHRNA10Q9GZZ6 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CHRNA10Q9GZZ6 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CHRNA10Q9GZZ6 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CHRNA10Q9GZZ6 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CHRNA10Q9GZZ6 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CHRNA10Q9GZZ6 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CHRNA10Q9GZZ6 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CHRNA10Q9GZZ6 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CHRNA10Q9GZZ6 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CHRNA10Q9GZZ6 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CHRNA10Q9GZZ6 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CHRNA10Q9GZZ6 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CHRNA10Q9GZZ6 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CHRNA10Q9GZZ6 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CHRNA10Q9GZZ6 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CHRNA10Q9GZZ6 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CHRNA10Q9GZZ6 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CHRNA10Q9GZZ6 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CHRNA10Q9GZZ6 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CHRNA10Q9GZZ6 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CHRNA10Q9GZZ6 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CHRNA10Q9GZZ6 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CHRNA10Q9GZZ6 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CHRNA10Q9GZZ6 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CHRNA10Q9GZZ6 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CHRNA10Q9GZZ6 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
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