Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY49

PECR, Peroxisomal trans-2-enoyl-CoA reductase, humanhuman

Predictions only

Length 303 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PECRQ9BY49 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PECRQ9BY49 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PECRQ9BY49 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PECRQ9BY49 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PECRQ9BY49 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PECRQ9BY49 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PECRQ9BY49 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PECRQ9BY49 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PECRQ9BY49 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
PECRQ9BY49 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PECRQ9BY49 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PECRQ9BY49 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PECRQ9BY49 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PECRQ9BY49 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PECRQ9BY49 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PECRQ9BY49 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PECRQ9BY49 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PECRQ9BY49 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PECRQ9BY49 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PECRQ9BY49 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PECRQ9BY49 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PECRQ9BY49 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PECRQ9BY49 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PECRQ9BY49 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PECRQ9BY49 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PECRQ9BY49 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PECRQ9BY49 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PECRQ9BY49 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PECRQ9BY49 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PECRQ9BY49 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PECRQ9BY49 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PECRQ9BY49 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PECRQ9BY49 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PECRQ9BY49 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
PECRQ9BY49 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PECRQ9BY49 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PECRQ9BY49 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PECRQ9BY49 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PECRQ9BY49 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
PECRQ9BY49 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
PECRQ9BY49 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PECRQ9BY49 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PECRQ9BY49 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PECRQ9BY49 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PECRQ9BY49 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PECRQ9BY49 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PECRQ9BY49 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PECRQ9BY49 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PECRQ9BY49 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PECRQ9BY49 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PECRQ9BY49 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PECRQ9BY49 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PECRQ9BY49 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PECRQ9BY49 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PECRQ9BY49 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PECRQ9BY49 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PECRQ9BY49 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PECRQ9BY49 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PECRQ9BY49 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PECRQ9BY49 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PECRQ9BY49 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PECRQ9BY49 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PECRQ9BY49 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PECRQ9BY49 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PECRQ9BY49 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PECRQ9BY49 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PECRQ9BY49 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PECRQ9BY49 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PECRQ9BY49 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PECRQ9BY49 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PECRQ9BY49 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PECRQ9BY49 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PECRQ9BY49 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PECRQ9BY49 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PECRQ9BY49 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PECRQ9BY49 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
PECRQ9BY49 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PECRQ9BY49 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PECRQ9BY49 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PECRQ9BY49 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PECRQ9BY49 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PECRQ9BY49 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PECRQ9BY49 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
PECRQ9BY49 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PECRQ9BY49 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
PECRQ9BY49 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PECRQ9BY49 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PECRQ9BY49 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PECRQ9BY49 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PECRQ9BY49 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PECRQ9BY49 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PECRQ9BY49 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PECRQ9BY49 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PECRQ9BY49 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PECRQ9BY49 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PECRQ9BY49 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PECRQ9BY49 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PECRQ9BY49 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PECRQ9BY49 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PECRQ9BY49 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms