Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWW4

SSBP3, Single-stranded DNA-binding protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSBP3Q9BWW4 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SSBP3Q9BWW4 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SSBP3Q9BWW4 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SSBP3Q9BWW4 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SSBP3Q9BWW4 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SSBP3Q9BWW4 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SSBP3Q9BWW4 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SSBP3Q9BWW4 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SSBP3Q9BWW4 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SSBP3Q9BWW4 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SSBP3Q9BWW4 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SSBP3Q9BWW4 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SSBP3Q9BWW4 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SSBP3Q9BWW4 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SSBP3Q9BWW4 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SSBP3Q9BWW4 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SSBP3Q9BWW4 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SSBP3Q9BWW4 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SSBP3Q9BWW4 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SSBP3Q9BWW4 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SSBP3Q9BWW4 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SSBP3Q9BWW4 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SSBP3Q9BWW4 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SSBP3Q9BWW4 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SSBP3Q9BWW4 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SSBP3Q9BWW4 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SSBP3Q9BWW4 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SSBP3Q9BWW4 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SSBP3Q9BWW4 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SSBP3Q9BWW4 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
SSBP3Q9BWW4 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SSBP3Q9BWW4 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SSBP3Q9BWW4 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SSBP3Q9BWW4 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SSBP3Q9BWW4 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SSBP3Q9BWW4 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
SSBP3Q9BWW4 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SSBP3Q9BWW4 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SSBP3Q9BWW4 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SSBP3Q9BWW4 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SSBP3Q9BWW4 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
SSBP3Q9BWW4 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SSBP3Q9BWW4 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SSBP3Q9BWW4 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SSBP3Q9BWW4 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SSBP3Q9BWW4 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SSBP3Q9BWW4 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SSBP3Q9BWW4 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SSBP3Q9BWW4 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SSBP3Q9BWW4 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SSBP3Q9BWW4 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SSBP3Q9BWW4 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SSBP3Q9BWW4 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SSBP3Q9BWW4 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SSBP3Q9BWW4 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
SSBP3Q9BWW4 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SSBP3Q9BWW4 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SSBP3Q9BWW4 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SSBP3Q9BWW4 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SSBP3Q9BWW4 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SSBP3Q9BWW4 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SSBP3Q9BWW4 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SSBP3Q9BWW4 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
SSBP3Q9BWW4 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SSBP3Q9BWW4 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
SSBP3Q9BWW4 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
SSBP3Q9BWW4 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
SSBP3Q9BWW4 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
SSBP3Q9BWW4 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SSBP3Q9BWW4 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ 0
SSBP3Q9BWW4 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SSBP3Q9BWW4 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SSBP3Q9BWW4 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SSBP3Q9BWW4 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SSBP3Q9BWW4 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SSBP3Q9BWW4 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SSBP3Q9BWW4 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SSBP3Q9BWW4 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SSBP3Q9BWW4 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SSBP3Q9BWW4 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SSBP3Q9BWW4 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SSBP3Q9BWW4 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SSBP3Q9BWW4 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SSBP3Q9BWW4 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SSBP3Q9BWW4 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SSBP3Q9BWW4 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SSBP3Q9BWW4 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SSBP3Q9BWW4 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SSBP3Q9BWW4 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SSBP3Q9BWW4 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SSBP3Q9BWW4 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SSBP3Q9BWW4 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SSBP3Q9BWW4 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SSBP3Q9BWW4 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SSBP3Q9BWW4 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SSBP3Q9BWW4 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SSBP3Q9BWW4 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SSBP3Q9BWW4 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SSBP3Q9BWW4 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SSBP3Q9BWW4 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms