Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW72

HIGD2A, HIG1 domain family member 2A, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIGD2AQ9BW72 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
HIGD2AQ9BW72 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
HIGD2AQ9BW72 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
HIGD2AQ9BW72 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
HIGD2AQ9BW72 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
HIGD2AQ9BW72 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
HIGD2AQ9BW72 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
HIGD2AQ9BW72 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
HIGD2AQ9BW72 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
HIGD2AQ9BW72 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
HIGD2AQ9BW72 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
HIGD2AQ9BW72 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
HIGD2AQ9BW72 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
HIGD2AQ9BW72 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
HIGD2AQ9BW72 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
HIGD2AQ9BW72 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
HIGD2AQ9BW72 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
HIGD2AQ9BW72 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
HIGD2AQ9BW72 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
HIGD2AQ9BW72 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
HIGD2AQ9BW72 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
HIGD2AQ9BW72 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
HIGD2AQ9BW72 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
HIGD2AQ9BW72 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
HIGD2AQ9BW72 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
HIGD2AQ9BW72 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
HIGD2AQ9BW72 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
HIGD2AQ9BW72 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
HIGD2AQ9BW72 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
HIGD2AQ9BW72 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
HIGD2AQ9BW72 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
HIGD2AQ9BW72 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
HIGD2AQ9BW72 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
HIGD2AQ9BW72 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
HIGD2AQ9BW72 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
HIGD2AQ9BW72 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
HIGD2AQ9BW72 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
HIGD2AQ9BW72 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
HIGD2AQ9BW72 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
HIGD2AQ9BW72 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
HIGD2AQ9BW72 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
HIGD2AQ9BW72 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
HIGD2AQ9BW72 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
HIGD2AQ9BW72 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
HIGD2AQ9BW72 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
HIGD2AQ9BW72 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
HIGD2AQ9BW72 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
HIGD2AQ9BW72 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
HIGD2AQ9BW72 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
HIGD2AQ9BW72 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
HIGD2AQ9BW72 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
HIGD2AQ9BW72 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
HIGD2AQ9BW72 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
HIGD2AQ9BW72 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
HIGD2AQ9BW72 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
HIGD2AQ9BW72 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
HIGD2AQ9BW72 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC11.48□□□□□ -0.57
HIGD2AQ9BW72 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
HIGD2AQ9BW72 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
HIGD2AQ9BW72 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
HIGD2AQ9BW72 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
HIGD2AQ9BW72 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
HIGD2AQ9BW72 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
HIGD2AQ9BW72 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
HIGD2AQ9BW72 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
HIGD2AQ9BW72 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
HIGD2AQ9BW72 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
HIGD2AQ9BW72 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
HIGD2AQ9BW72 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
HIGD2AQ9BW72 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
HIGD2AQ9BW72 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
HIGD2AQ9BW72 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
HIGD2AQ9BW72 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
HIGD2AQ9BW72 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
HIGD2AQ9BW72 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
HIGD2AQ9BW72 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
HIGD2AQ9BW72 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
HIGD2AQ9BW72 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
HIGD2AQ9BW72 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
HIGD2AQ9BW72 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
HIGD2AQ9BW72 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
HIGD2AQ9BW72 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
HIGD2AQ9BW72 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
HIGD2AQ9BW72 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC11.47□□□□□ -0.57
HIGD2AQ9BW72 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
HIGD2AQ9BW72 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
HIGD2AQ9BW72 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
HIGD2AQ9BW72 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
HIGD2AQ9BW72 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
HIGD2AQ9BW72 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
HIGD2AQ9BW72 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
HIGD2AQ9BW72 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC11.47□□□□□ -0.57
HIGD2AQ9BW72 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
HIGD2AQ9BW72 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
HIGD2AQ9BW72 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
HIGD2AQ9BW72 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
HIGD2AQ9BW72 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
HIGD2AQ9BW72 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC11.47□□□□□ -0.57
HIGD2AQ9BW72 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
HIGD2AQ9BW72 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms