Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVA0

KATNB1, Katanin p80 WD40 repeat-containing subunit B1, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KATNB1Q9BVA0 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KATNB1Q9BVA0 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KATNB1Q9BVA0 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KATNB1Q9BVA0 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KATNB1Q9BVA0 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
KATNB1Q9BVA0 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KATNB1Q9BVA0 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KATNB1Q9BVA0 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KATNB1Q9BVA0 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
KATNB1Q9BVA0 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KATNB1Q9BVA0 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KATNB1Q9BVA0 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KATNB1Q9BVA0 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KATNB1Q9BVA0 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KATNB1Q9BVA0 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KATNB1Q9BVA0 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KATNB1Q9BVA0 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KATNB1Q9BVA0 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KATNB1Q9BVA0 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KATNB1Q9BVA0 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KATNB1Q9BVA0 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
KATNB1Q9BVA0 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KATNB1Q9BVA0 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KATNB1Q9BVA0 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KATNB1Q9BVA0 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KATNB1Q9BVA0 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KATNB1Q9BVA0 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KATNB1Q9BVA0 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KATNB1Q9BVA0 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KATNB1Q9BVA0 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KATNB1Q9BVA0 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
KATNB1Q9BVA0 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KATNB1Q9BVA0 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KATNB1Q9BVA0 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KATNB1Q9BVA0 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KATNB1Q9BVA0 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KATNB1Q9BVA0 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KATNB1Q9BVA0 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KATNB1Q9BVA0 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KATNB1Q9BVA0 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
KATNB1Q9BVA0 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KATNB1Q9BVA0 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KATNB1Q9BVA0 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KATNB1Q9BVA0 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KATNB1Q9BVA0 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KATNB1Q9BVA0 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KATNB1Q9BVA0 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KATNB1Q9BVA0 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KATNB1Q9BVA0 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KATNB1Q9BVA0 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KATNB1Q9BVA0 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
KATNB1Q9BVA0 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KATNB1Q9BVA0 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KATNB1Q9BVA0 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KATNB1Q9BVA0 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KATNB1Q9BVA0 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KATNB1Q9BVA0 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KATNB1Q9BVA0 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KATNB1Q9BVA0 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KATNB1Q9BVA0 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KATNB1Q9BVA0 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KATNB1Q9BVA0 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KATNB1Q9BVA0 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KATNB1Q9BVA0 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KATNB1Q9BVA0 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KATNB1Q9BVA0 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
KATNB1Q9BVA0 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KATNB1Q9BVA0 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KATNB1Q9BVA0 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KATNB1Q9BVA0 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KATNB1Q9BVA0 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KATNB1Q9BVA0 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KATNB1Q9BVA0 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KATNB1Q9BVA0 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KATNB1Q9BVA0 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KATNB1Q9BVA0 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KATNB1Q9BVA0 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KATNB1Q9BVA0 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
KATNB1Q9BVA0 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KATNB1Q9BVA0 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KATNB1Q9BVA0 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KATNB1Q9BVA0 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KATNB1Q9BVA0 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KATNB1Q9BVA0 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
KATNB1Q9BVA0 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KATNB1Q9BVA0 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
KATNB1Q9BVA0 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KATNB1Q9BVA0 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
KATNB1Q9BVA0 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KATNB1Q9BVA0 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KATNB1Q9BVA0 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KATNB1Q9BVA0 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KATNB1Q9BVA0 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KATNB1Q9BVA0 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
KATNB1Q9BVA0 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KATNB1Q9BVA0 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KATNB1Q9BVA0 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KATNB1Q9BVA0 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KATNB1Q9BVA0 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KATNB1Q9BVA0 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms