Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ95

ECSIT, Evolutionarily conserved signaling intermediate in Toll pathway, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECSITQ9BQ95 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ECSITQ9BQ95 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ECSITQ9BQ95 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ECSITQ9BQ95 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ECSITQ9BQ95 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ECSITQ9BQ95 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ECSITQ9BQ95 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ECSITQ9BQ95 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ECSITQ9BQ95 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ECSITQ9BQ95 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ECSITQ9BQ95 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ECSITQ9BQ95 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ECSITQ9BQ95 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ECSITQ9BQ95 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ECSITQ9BQ95 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ECSITQ9BQ95 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ECSITQ9BQ95 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ECSITQ9BQ95 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ECSITQ9BQ95 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ECSITQ9BQ95 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ECSITQ9BQ95 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
ECSITQ9BQ95 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ECSITQ9BQ95 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ECSITQ9BQ95 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ECSITQ9BQ95 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ECSITQ9BQ95 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ECSITQ9BQ95 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ECSITQ9BQ95 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ECSITQ9BQ95 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ECSITQ9BQ95 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ECSITQ9BQ95 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ECSITQ9BQ95 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ECSITQ9BQ95 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ECSITQ9BQ95 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ECSITQ9BQ95 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ECSITQ9BQ95 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ECSITQ9BQ95 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ECSITQ9BQ95 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ECSITQ9BQ95 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ECSITQ9BQ95 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ECSITQ9BQ95 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ECSITQ9BQ95 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ECSITQ9BQ95 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ECSITQ9BQ95 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ECSITQ9BQ95 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ECSITQ9BQ95 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ECSITQ9BQ95 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ECSITQ9BQ95 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ECSITQ9BQ95 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ECSITQ9BQ95 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ECSITQ9BQ95 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ECSITQ9BQ95 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ECSITQ9BQ95 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ECSITQ9BQ95 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ECSITQ9BQ95 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ECSITQ9BQ95 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ECSITQ9BQ95 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ECSITQ9BQ95 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ECSITQ9BQ95 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ECSITQ9BQ95 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ECSITQ9BQ95 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
ECSITQ9BQ95 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ECSITQ9BQ95 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ECSITQ9BQ95 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ECSITQ9BQ95 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ECSITQ9BQ95 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ECSITQ9BQ95 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ECSITQ9BQ95 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ECSITQ9BQ95 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
ECSITQ9BQ95 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ECSITQ9BQ95 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ECSITQ9BQ95 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ECSITQ9BQ95 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ECSITQ9BQ95 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ECSITQ9BQ95 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ECSITQ9BQ95 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ECSITQ9BQ95 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ECSITQ9BQ95 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ECSITQ9BQ95 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ECSITQ9BQ95 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ECSITQ9BQ95 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ECSITQ9BQ95 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ECSITQ9BQ95 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ECSITQ9BQ95 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ECSITQ9BQ95 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ECSITQ9BQ95 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ECSITQ9BQ95 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
ECSITQ9BQ95 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ECSITQ9BQ95 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ECSITQ9BQ95 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ECSITQ9BQ95 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ECSITQ9BQ95 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ECSITQ9BQ95 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
ECSITQ9BQ95 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
ECSITQ9BQ95 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ECSITQ9BQ95 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ECSITQ9BQ95 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
ECSITQ9BQ95 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ECSITQ9BQ95 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ECSITQ9BQ95 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms