Protein–RNA interactions for Protein: Q99697

PITX2, Pituitary homeobox 2, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX2Q99697 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
PITX2Q99697 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PITX2Q99697 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PITX2Q99697 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PITX2Q99697 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
PITX2Q99697 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PITX2Q99697 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PITX2Q99697 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
PITX2Q99697 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
PITX2Q99697 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PITX2Q99697 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PITX2Q99697 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
PITX2Q99697 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PITX2Q99697 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PITX2Q99697 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PITX2Q99697 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PITX2Q99697 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PITX2Q99697 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
PITX2Q99697 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PITX2Q99697 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PITX2Q99697 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PITX2Q99697 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PITX2Q99697 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PITX2Q99697 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PITX2Q99697 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PITX2Q99697 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PITX2Q99697 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PITX2Q99697 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PITX2Q99697 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PITX2Q99697 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PITX2Q99697 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PITX2Q99697 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PITX2Q99697 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PITX2Q99697 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PITX2Q99697 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PITX2Q99697 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PITX2Q99697 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PITX2Q99697 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PITX2Q99697 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PITX2Q99697 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PITX2Q99697 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PITX2Q99697 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PITX2Q99697 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PITX2Q99697 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PITX2Q99697 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PITX2Q99697 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PITX2Q99697 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PITX2Q99697 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PITX2Q99697 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PITX2Q99697 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PITX2Q99697 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PITX2Q99697 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PITX2Q99697 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PITX2Q99697 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PITX2Q99697 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PITX2Q99697 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PITX2Q99697 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PITX2Q99697 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PITX2Q99697 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PITX2Q99697 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PITX2Q99697 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
PITX2Q99697 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PITX2Q99697 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PITX2Q99697 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PITX2Q99697 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PITX2Q99697 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PITX2Q99697 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PITX2Q99697 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PITX2Q99697 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PITX2Q99697 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PITX2Q99697 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PITX2Q99697 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PITX2Q99697 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PITX2Q99697 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
PITX2Q99697 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
PITX2Q99697 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PITX2Q99697 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PITX2Q99697 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
PITX2Q99697 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PITX2Q99697 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PITX2Q99697 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PITX2Q99697 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PITX2Q99697 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PITX2Q99697 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PITX2Q99697 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PITX2Q99697 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PITX2Q99697 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PITX2Q99697 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PITX2Q99697 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PITX2Q99697 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PITX2Q99697 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PITX2Q99697 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PITX2Q99697 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PITX2Q99697 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PITX2Q99697 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PITX2Q99697 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PITX2Q99697 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PITX2Q99697 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PITX2Q99697 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PITX2Q99697 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.1 ms