Protein–RNA interactions for Protein: Q96LD4

TRIM47, Tripartite motif-containing protein 47, humanhuman

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM47Q96LD4 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRIM47Q96LD4 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRIM47Q96LD4 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRIM47Q96LD4 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRIM47Q96LD4 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRIM47Q96LD4 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRIM47Q96LD4 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRIM47Q96LD4 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRIM47Q96LD4 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRIM47Q96LD4 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
TRIM47Q96LD4 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRIM47Q96LD4 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRIM47Q96LD4 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRIM47Q96LD4 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRIM47Q96LD4 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRIM47Q96LD4 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRIM47Q96LD4 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRIM47Q96LD4 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRIM47Q96LD4 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRIM47Q96LD4 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRIM47Q96LD4 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
TRIM47Q96LD4 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRIM47Q96LD4 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRIM47Q96LD4 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TRIM47Q96LD4 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TRIM47Q96LD4 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TRIM47Q96LD4 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TRIM47Q96LD4 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TRIM47Q96LD4 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TRIM47Q96LD4 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TRIM47Q96LD4 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TRIM47Q96LD4 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TRIM47Q96LD4 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TRIM47Q96LD4 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TRIM47Q96LD4 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TRIM47Q96LD4 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TRIM47Q96LD4 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TRIM47Q96LD4 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TRIM47Q96LD4 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TRIM47Q96LD4 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TRIM47Q96LD4 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TRIM47Q96LD4 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TRIM47Q96LD4 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TRIM47Q96LD4 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
TRIM47Q96LD4 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
TRIM47Q96LD4 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
TRIM47Q96LD4 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.96
TRIM47Q96LD4 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
TRIM47Q96LD4 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
TRIM47Q96LD4 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
TRIM47Q96LD4 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
TRIM47Q96LD4 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
TRIM47Q96LD4 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
TRIM47Q96LD4 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRIM47Q96LD4 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRIM47Q96LD4 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRIM47Q96LD4 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRIM47Q96LD4 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRIM47Q96LD4 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
TRIM47Q96LD4 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRIM47Q96LD4 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
TRIM47Q96LD4 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRIM47Q96LD4 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRIM47Q96LD4 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRIM47Q96LD4 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRIM47Q96LD4 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRIM47Q96LD4 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRIM47Q96LD4 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRIM47Q96LD4 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRIM47Q96LD4 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRIM47Q96LD4 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
TRIM47Q96LD4 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRIM47Q96LD4 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TRIM47Q96LD4 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TRIM47Q96LD4 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TRIM47Q96LD4 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TRIM47Q96LD4 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TRIM47Q96LD4 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TRIM47Q96LD4 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TRIM47Q96LD4 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TRIM47Q96LD4 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
TRIM47Q96LD4 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TRIM47Q96LD4 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TRIM47Q96LD4 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TRIM47Q96LD4 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TRIM47Q96LD4 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TRIM47Q96LD4 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TRIM47Q96LD4 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TRIM47Q96LD4 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
TRIM47Q96LD4 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
TRIM47Q96LD4 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TRIM47Q96LD4 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TRIM47Q96LD4 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TRIM47Q96LD4 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TRIM47Q96LD4 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TRIM47Q96LD4 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TRIM47Q96LD4 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TRIM47Q96LD4 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TRIM47Q96LD4 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TRIM47Q96LD4 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.5 ms